项目名称:14个白千层样品全转录组建库测序
项目编号:ZXCG-JJ-220185
采购单位:
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预 算: ￥ 57000
供应商资质要求: 符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件
采购商品:14个白千层样本全转录组建库测序：
采购数量:1
计量单位:项
所属分类:其他服务行业
品牌:无指定
型号:无指定
技术参数及配置要求:1、完成14个白千层样本的RNA提取。RNA样本质检标准：RIN（RNA完整系数）≥7.0且OD260/280≥1.8，OD260/OD230≥1，总量≥3μg，浓度≥100 ng/ul。无DNA及蛋白污染；无rRNA残留；所有样本确保满足RNA质量要求，否则免费重新抽提，直至质量达标。
2、基于Illumina测序平台，利用双末端测序的方法，构建14个白千层样本的去rRNA的链特异性文库并测序获得mRNA+LncRNA+CircRNA的测序数据。全转录组测序质量标准：采用二代高通量测序平台进行PE150测序，确保每个样本可用测序数据量大于10G且碱基类型分布均匀。
3、服务周期：20个工作日。
二、14个白千层样本的全转录组分析：
完成14个白千层样本的全转录组数据分析，主要分析内容包括：
1、标准分析
1.1、测序数据质控；
1.2、参考基因组比对；
1.3、基因表达定量分析；
1.4、基因差异表达分析；
1.5、可变剪接分析；
1.6、SNP分析；
1.7、新基因、新转录本预测
1.8、差异表达基因富集分析；
1.9、蛋白质互作网络分析.
2、circRNA测序分析
2.1、circRNA与mRNA共表达网络分析。
3、LncRNA测序分析
3.1、lncRNA与mRNA共表达网络分析。
4、服务周期：7个工作日。
三、14个白千层样本的差异基因表达分析验证：
1、利用荧光定量PCR技术对14个白千层样本的mRNA测序结果进行验证。
2、利用数字PCR技术对14个白千层样本的lncRNA和circRNA测序结果进行验证。
3、服务周期：5个工作日。
四、服务年限:质保期一年。
售后服务:服务年限:质保期一年;

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