招标
中山大学附属肿瘤医院-竞价公告(CBSYSUCC2022000711)
金额
-
项目地址
广东省
发布时间
2022/11/16
公告摘要
公告正文
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中山大学附属肿瘤医院 - 竞价公告 (CBSYSUCC2022000711)
发布时间:2022-11-16 09:19:31 截止时间:2022-11-21 09:00:00
基本信息:
申购明细:
序号
1
采购内容
NGS基因组数据分析加速软件
数量
1套
预算单价
品牌
森特(Sentieon)
型号
v202112.05
规格参数
全模块,教育科研用途 技术参数: 1、基因组分析加速软件可支持Linux主流发行版,即Ubuntu和Centos。 2、基因组分析加速软件必须包含创建基因组索引功能。 3、基因组分析加速软件必须包含序列比对功能。 4、基因组分析加速软件必须包含三代长度长流程加速功能。 4、基因组分析加速软件必须包含变异查找功能。 5、基因组分析加速软件必须包含变异位点群体分析功能,参与万人以上人群项目不少于2个。 6、基因组分析加速软件利用CPU计算性能进行任务加速,不依赖GPU、FPGA等特殊硬件卡。 7. 基因组分析加速软件需支持ARM架构硬件平台。 7、基因组分析加速软件遵循行业标准BWA+GATK流程和Mutect2标准流程,各步骤可以拆分并且可以获得各步骤中间文件。 8、基因组分析加速软件与标准流程(BWA+GATK最佳实践流程, 简称Std)、Mutect2获得变异检测信息的一致性可以高达99%以上。 9、兼容MGI、Illumina、Pacbio等多个测序平台; 11、性能指标: 胚系变异分析流程相比BWA-GATK开源流程提速5-10倍; 胚系变异错检率叫GATK开源流程低2~3倍; 体细胞变异分析流程相较开源BWA-Mutect2开源流程提速5-10倍; 体细胞变异流程支持肿瘤-正常组织配对,纯肿瘤,肿瘤+正常基线等多种样本类型; 12、同时提供支持超算调度软件调用和容器调用2种使用方式。 13、所提供软件提供可以查阅的发表文献引用不少于100篇。
质保及售后服务
按行业标准提供服务
附件
源文地址:https://www.easyjcx.com/#/purchase/detail/b25bd7b8cd654444810fe2ae500d88ba
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