招标
DNA样本全基因组重测序数据采集技术服务-华中农业大学-竞价公告(CB105042024000143)
金额
14.04万元
项目地址
湖北省
发布时间
2024/11/04
公告摘要
公告正文
华中农业大学 - 竞价公告 (CB105042024000143)
发布时间:2024-11-04 11:37:53 截止时间:2024-11-11 11:37:42
基本信息:
申购主题:DNA样本全基因组重测序数据采集技术服务
报价要求:国产含税
发票类型:增值税专用发票
付款方式:货到验收合格后付款
送货时间:合同签订后7天内送达
安装要求:免费上门安装(含材料费)
预算:140430 人民币
收货地址:湖北省武汉市/武汉市/洪山区/****
供应商资质:
备注说明:
采购明细:
序号 | 设备名称 | 数量/单位 | 预算单价 | 品牌 | 型号 | 规格参数 | 质保及售后服务 | 附件 |
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1 | DNA样本全基因组重测序数据采集技术服务 | 302(个) | 465 | 华大 | MGI-T7测序平台 | 1.基于华大MGI-T7测序平台,利用PE150测序模式,完成302个DNA样品重测序检测以及GWAS分析工作。 2.技术参数 (1)DNA完成样品质量的检测(琼脂糖凝胶电泳分析DNA降解程度以及是否存在杂带、RNA及蛋白污染;Qubit 2.0对DNA浓度进行精确定量),所有样品均按标准进行建库和二代测序平台测序。 (2)采用Yingzigene® DNA Library Prep Kit for MGI试剂盒对质检合格的DNA构建重测序文库,文库构建完成后,使用Qubit2.0进行初步定量,使用qPCR的方法对文库的有效浓度进行准确定量以保证文库质量。文库质量检测合格后,利用华大MGI-2000/MGI-T7测序平台进行测序,测序模式为PE150模式。 (3)数据质量:每个样本产生的数据量不低于36Gb clean data,在总数据量足够的情况下,平均Q30≥90%,碱基类型(ATCG)分布均匀,且无GC分离。完成测序数据过滤,交付Clean Data。 (4)数据分析:完成测序数据过滤,完成SNP Calling,完成302个样本的群体进化分析,以及35条性状的GWAS分析;交付clean data,VCF以及结果文件。 (5)项目周期:样本检测合格次日起到乙方向甲方提供建库测序结题报告的周期。35个日历天内完成302份样本测序和分析工作,并出具结题报告。 (6)报价需包含完成302个样品重测序和相关分析过程产生的所有费用,含但不限于测序过程的相关开支费用(包括基因组DNA质检、文库构建、文库质量检测、失败后重新建库测序、数控、人员等费用)。 | 1.样本保存期:DNA质检合格之日算起,后续所有费用由供应商承担;DNA样本保存6个月; 2.数据储存保存期:项目交付后,原始数据保存3个月;结果文件,保存6个月;若需延长保存期限,请提前与供应商联系; 3.运输费用:DNA取样和返样快递费用,以及干冰费用等均由供应商承担; 4.响应时间:工作日5天,24小时,相应客户需求。 |
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