招标
(交互式非靶向代谢组学分析实验等服务)深圳大学-竞价公告(CF105902021002033)
金额
6.2万元
项目地址
广东省
发布时间
2021/11/16
公告摘要
公告正文
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深圳大学 - 竞价公告 (CF105902021002033)
发布时间:2021-11-16 19:29:31截止时间:2021-11-23 12:00:00
基本信息:
申购明细:
序号
1
采购内容
交互式非靶向代谢组学分析实验服务
数量
64样
预算单价
品牌
型号
规格参数
(1)本实验首先精确量取一定质量的样本,于低温环境下加入提取液进行(组织、细胞等样品 需先经研磨)代谢物萃取处理,后离心取上清代谢产物溶剂进行液相质谱检测。下机数据采用代谢组学软件Progenesis QI(WatersCorporation,Milford,USA)进行峰提取、对齐、鉴定等,最终得到含保留时间、峰面积、质荷比以及鉴定信息的数据矩阵,用于后期处理及生信分析。(2)样本前处理:1.精确称取50 mg样品至2 mL离心管中,加入一颗直径6 mm的研磨珠;2.加入400 µL提取液(甲醇:水=4:1(v:v)),含0.02 mg/mL的内标(L-2-氯苯丙氨酸);3.冷冻组织研磨仪研磨6 min(-10℃,50 Hz);4.低温超声提取30 min(5℃,40 KHz);5.将样品静置于-20℃,30 min;6.离心15 min(13000 g,4℃),移取上清液至带内插管的进样小瓶中上机分析;7.另外,每个样本分别移取20 µL上清液,混合后作为质控样本。(3)样本分析/数据采集:LC-MS。(4)代谢物搜库:主要数据库为http://www.hmdb.ca/、https://metlin.scripps.edu/等主流公共数据库以及自建的数据库。(5)乙方为甲方提供附件中的交互式代谢组学云分析服务。
质保及售后服务
按行业标准提供服务
序号
2
采购内容
Label free蛋白质组检测与交互式云分析
数量
15样
预算单价
品牌
型号
规格参数
(1)样本提取和质检:总蛋白质提取及含量测定,SDS-PAGE电泳质控;样本提取数量:31样本质检数量:31。本项目操作过程如下:1.取适量样品,液氮研磨;2.按1:5比例加入蛋白裂解液(8M 尿素+1%SDS,含cocktail);3.16000g、4℃离心30 min取上清;4.加入5倍体积预冷的丙酮,-20℃沉淀过夜;5.12000g、4℃离心30 min,收集沉淀;6.沉淀加入90%预冷的丙酮清洗并风干;7.沉淀用适量蛋白裂解液(8M 尿素+1%SDS,含cocktail)溶解,离心取蛋白上。(2)正式实验:① 蛋白质还原烷基化、酶解并脱盐;② LC-MS/MS中级分析(根据上机时间选择);③ 上机次数1次(上机次数即每个样本上机的次数,默认为1;若每个样需多次上机,则乘以相应倍数)。(3)交互式生物信息云分析:乙方为甲方提供附件中的交互式Labelfree蛋白组云分析服务,甲方在合同有效期内享有本合同数据的交互式 云分析服务。
质保及售后服务
按行业标准提供服务
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原文地址:https://www.easyjcx.com/#/purchase/detail/e41734c1e30644129879697ef67ec093
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