公告摘要
项目编号bx20230035
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公告正文
项目名称:肠道单细胞测序
项目编号:BX20230035
公告开始日期:2023-12-08 17:03:35
公告截止日期:2023-12-13 18:00:00
采购单位:西北农林科技大学
预算总价:¥396000
收货地址:
采购商品:肠道单细胞测序
采购数量:22
计量单位:项
技术参数及配置要求:"服务平台要求
(1)检测技术方法:10× Genomics ChromiumTM平台采用微流控技术形成油包水微体系分离单细胞,逆转录mRNA构建带有10x标签的cDNA文库并进行二代测序;
"服务技术参数
测序策略:双端测序PE150;
测序量:20k reads/cell,100G原始测序量;
原始数据质控预处理软件:10x genomics官方软件Cell Ranger;
基因比对软件:STAR (Spliced Transcripts Alignment to a Reference);
基因定量后质控数据标准化处理包:Seurat;"
服务分析要求:1.测序数据质量评估;2.基因定量质控;3.去除批次效应;4.降维聚类和可视化;5.Marker 基因鉴定与可视化;6.细胞类型鉴定;7.差异基因表达分析;8.基因集富集分析;9.细胞亚群鉴定;10.拟时序分析;11.细胞间通讯;12.转录因子调控网络;13.其他客户要求的特殊数据分析
"服务商要求:
1.服务商拥有不少于3台10X 10x Chromium Controller系统和1台10x Genomics Chromium X系统。
2.服务商配备的生信信息分析人员和技术支持人员经验丰富。
3.服务商拥有丰富的高通量单细胞转录组服务经验。
4.有CNAS实验室认可证书,ISO9001质量认证证书,单细胞相关计算机软件著作登记权证书×1,自助云平台,样本运输及存储方案"
"服务期限:
2023年12月15日-2026年12月15日。
预算单价:18000详情请下载附件!
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