1.招标条件 
　　昆明华辰招标代理有限公司受云南省烟草农业科学研究院委托，就云南省烟草农业科学研究院2022年蛋白组学分析、高通量数据分析及文库构建、代谢组学检测项目（项目编号：HCZB02202205025）进行公开招标，项目已具备招标条件，欢迎具有相应资格的单位参与投标。 
2.项目概况 
　　2.1项目名称：云南省烟草农业科学研究院2022年蛋白组学分析、高通量数据分析及文库构建、代谢组学检测。 
　　2.2招标范围：负责完成云南省烟草农业科学研究院2022年蛋白组学分析、高通量数据分析及文库构建、代谢组学检测，并出具检测报告。 
　　2.3标包划分： 

标包	项目名称	检测项目	分项	规格
一标包	蛋白组学	蛋白组学分析	基于TMT或iTRAQ的定量分析	定量，覆盖率＞95%
		蛋白磷酸化修饰分析	基于LC/MS	修饰位点个数、种类、分布位置统计,覆盖率＞98%
		PRM靶向定量		PRM
二标包	高通量数据分析及文库构建	原核转录组测序及分析	二代原核转录组测序（BGISEQ平台）	1Gb数据量、2G数据量
		细菌、真菌扩增子测序及分析	细菌16S扩增子测序（Illumina HiSeq 2500平台）：V4,V3-V4,V4-V5等；真菌ITS扩增子测序（Illumina HiSeq 2500平台）：ITS1或ITS2	100000tags
		细菌16S全长扩增子测序及分析	三代16S全长扩增子测序（PacBio SequelⅡ平台）	6000 reads
		细菌基因组完成图测序及分析	三代（PacBio SequelⅡ （或Nanopore）平台）+二代（BGISEQ平台）细菌基因组从头测序组装（完成图）	不少于细菌基因组150X
		细菌基因组重测序及分析	二代细菌基因组重测序（BGISEQ平台）	1Gb数据量
		宏基因组测序及分析	二代（BGISEQ平台）宏基因组测序	10Gb数据量
		宏病毒（宏转录）测序	基于Illumina平台及PacBio平台	10 G
		酵母cDNA文库构建	基于gateway和smart体系进行建库	平均插入片段＞1200bp；文库原始库容量＞1*10^7CFU；文库空载率＜5%。
		真核转录组测序及数据分析	真核转录组测序及数据分析	不低于8 G的clean data，并完成有参考基因组的相应质控（数据质量Q30 > 85%）及分析，包含数据的过滤及与参考基因组比对、表达量分析、样品间PCA分析、样品间皮尔森相关性分析、差异基因分析、基因注释、样品间基因韦恩图分析、Kegg分析等信息分析。
		烟草基因组与注释	烟草基因组与注释	基于二代数据（不少于100×，约450 Gb）、三代数据（不少于80×，约360 gb）及HiC数据（不少于120×，约540 Gb）组装并挂载烟草基因组，组装基因组Scaffold N50 > 1 Mb，挂载物理染色体比率 > 60%。在组装基因组基础上，基于同源基因、从头注释及转录组测序数据完成基因组的注释分析（含非编码区注释及编码区基因注释）。完成上述主要内容所需的其它必要分析。
		烟草基因组重测序与分析	烟草基因组重测序与分析，获得重测序数据并完成SNP与InDel多态分析。	4.5GB重测序数据量。根据样品数量及数据量构建文库进行测序及质控，Q30 > 85%。比对公共库烟草基因组或乙方提供基因组，完成SNP与InDel多态分析。
		烟草基因组HiC建库测序	烟草基因组HiC文库构建及测序	以烟草基因组DNA为材料，构建HiC文库进行测序及质控，Q30 > 85%,达到质控标准的测序数据量不少于540 Gb。
		混池（BSA）分型及分析	混池（BSA）分型及分析	混合样本SNP-index值计算及分析，按照基础数据量（G)核算分析量。
三标包	代谢组学检测	代谢组学		非靶向代谢组学
		代谢组学		类靶向代谢组学
		代谢组学		靶向代谢组学
		代谢组学		靶向代谢N300
		代谢组学		脂质组学
		代谢组学		风味代谢组学

　　注：本项目采用“兼投兼中”的形式，即投标人可同时参加3个标包投标，中3个标包，不同标包的投标人应分别编制、递交投标文件。 
　　2.4服务地点：昆明、玉溪。 
　　2.5服务期限：自合同签订之日起至2022年12月31日止。 
　　2.6检测期限：满足招标人检测期限要求。 
　  2.7质量要求：符合国家、行业现行相关标准，完全满足招标文件中的服务标准及要求。 
3.投标人资格要求 
　　3.1投标人须具有独立承担民事责任的能力,在中华人民共和国境内注册的法人或者其他组织，提供有效的营业执照； 
　　3.2投标人具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度，提供近三年（2019-2021年或2018-2020）财务报表。【注：成立不足3年的，则提供成立至今的财务报表（包括但不限于资产负债表、现金流量表、利润表）；若为2021年新成立的公司，提供银行开具的资信证明文件或财务报表。】 
　　3.3投标人近三年（2019年至今）至少具有1项类似检测项目业绩； 
　　3.4信誉要求：投标人在投标截止时间前没有处于被责令停业、被禁止市场准入或者投标资格被暂停、取消，或者财务被接管、冻结、破产等状态，投标人的分支机构负责人、高级管理人员无行贿犯罪记录（投标人自行承诺，并盖投标人公章）；投标人及其法定代表人在“信用中国”网未被列入“失信被执行人名单”名单，（由招标代理机构查询后提供给评标委员会评审）；投标人及其法定代表人无行贿犯罪记录（由招标代理机构在“中国裁判文书网”上查询后提供给评标委员会评审）；投标人未在招标人或招标人上级单位提供的不良行为记录名单内（以招标人核查结果为准）。 
　　3.5本项目不接受联合体投标。 
4.资格审查方式 
　　4.1本项目采用资格后审的方式。 
5.招标文件的获取 
　　5.1凡有意参加投标者，请于2022年5月19日至2022年5月26日（法定公休日、法定节假日除外），每日上午9:00时至12:00时，下午14:00时至17:00时（北京时间，下同）获取招标文件。
　　5.2招标文件每份400元。
　　5.3招标文件获取方式：
　　微信获取：关注“华辰招标”微信公众号—点击公众号底部菜单栏“招标公告”—搜索进入对应项目招标公告—点击详情页底部“立即报名”（注：首次使用微信报名系统的投标人需要按系统提示首先完善企业基本信息）—填写项目联系人姓名、电话、邮箱，并在“上传附件”中上传报名资料—提交报名资料（法定代表人身份证明书、授权委托书、经办人身份证件、营业执照、本项目报名表的全套资料原件扫描件）—工作人员后台审核—报名资料审核成功后，投标人在微信系统中缴纳文件费—获取成功—工作人员以邮件形式传送电子版招标文件。
　　注：ios系统的手机，暂仅支持图片格式的附件资料上传。 
6.投标文件的递交 
　　6.1投标文件递交的截止时间（北京时间）为2022年6月9日9时30分。 
　　6.2投标文件的递交地点：云南省烟草农业科学研究院802会议室（昆明市圆通街33号。 
　　6.3逾期送达的或者未送达指定地点的投标文件，招标代理机构不予受理。 
7.发布公告的媒介 
　　7.1本次招标公告同时在《中国采购与招标网》、《中国招标投标公共服务平台》、《中国烟草总公司云南省公司外网》、《中国烟草总公司外网》上发布，招标人和招标代理机构对其他网站或媒体转载的公告及公告内容不承担任何责任。 
8.联系方式 
　　招   标   人：云南省烟草农业科学研究院 
　　地        址：昆明市圆通街33号 
　　联   系   人：王师 
　　电        话：0871-65107031 
　　招标代理机构：昆明华辰招标代理有限公司 
　　地        址：昆明市北京路900号颐高数码中心A座15楼 
　　联   系   人：凌江、任玉芳、张祖铭、王迪   
　　电        话：0871-64885051、64885057