中标
B20220104032个十字花科植物基因组近完成图组装与注释高等研究院17798216447272520.00人民币武汉希望组生物科技有限公司09:17:11
金额
27.25万元
项目地址
-
发布时间
2022/02/10
公告摘要
公告正文
[B2022010403]2个十字花科植物基因组近完成图组装与注释网上成交公告 发布时间：2022-02-10 09:17:11 阅读量：5次
成交信息
| 成交供应商 | 武汉希望组生物科技有限公司 | 成交金额 | 272520 |
| 成交理由 | 符合需求，价格最低 | ||
采购项目信息
| 项目名称 | 2个十字花科植物基因组近完成图组装与注释 | 项目编号 | B2022010403 |
| 开始时间 | 2022-01-05 14:54:22 | 截止时间 | 2022-01-10 14:54:22 |
| 供应商资格要求 | 参照《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定的资格条件。 | ||
采购货物信息列表
| 序号 | 货物（服务）名称 | 数量 | 计量单位 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2个十字花科植物基因组近完成图组装与注释 | 40 | Gb | ||||
| 技术参数 | 目标： 甲方提供符合如本合同附件所列举的要求的基因组DNA样品，乙方完成甲方所提供的受测样品的检测，并通过建库、Nanopore +Hi-C测序达到染色体级别的组装结果。 1.基因组survey： 甲方提供符合要求的10个组织样品，乙方完成甲方所提供的组织的提取与检测，每个样品，以基因组400 Mb为参考，测序深度50×，测序20 Gb，（不低于20 Gb），共10个样品，共200G，80%以上碱基质量值在Q30以上，完成基因组Survey测序分析。做完survey以后，选取2个样品做基因组近完成图。2.基因组测序： 甲方提供符合要求的2个组织样品，乙方完成甲方所提供的基因组DNA样品的提取、检测，并通过建库、Nanopore Ultra long测序。根据基因组情况：基因组以大小400 Mb为参考，每个样品测100X的Nanopore Ultra long测序，每个样品不低于40G，reads N50＞100kb，共测序约8个Flowcell，，利用合格的数据进行组装。 甲方提供符合要求的2个组织样品，乙方完成甲方所提供的基因组DNA样品的提取、检测，并通过建库、Pacbio HiFi测序。基因组以大小400 Mb为参考，每个样品测30X左右，每个样品数据量约12Gb，2个样品共24G数据，利用下机数据，进行组装。 3.Hi-C： 甲方提供2个样品的组织，乙方完成该样品的建库和测序，每个样品需构建1个文库，基因组大小按400M为参考，测序数据不低于100X，约40G，共月80G，利用测序的数据，乙方完成相应的基因组辅助组装信息分析，最终基因组版本达到染色体水平。 4.组装效果: BUSCO评估95%以上，基因组覆盖度95%，1-2条染色体达到端粒到端粒组装，全部contig数50个以内（杂合度不高于0.8%） 5.后期补洞： 根据组装的结果，确定后续补洞的方案，具体补洞的费用和方案需根据组装的最终结果，双方友好协商再定。 | ||||||
| 相关材料 | |||||||
武汉大学采购与招投标管理中心
2022-02-10 09:17:11
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