深圳大学 - 竞价公告 (CF105902023000637)
发布时间：2023-10-23 16:29:12 截止时间：2023-10-31 12:00:00
基本信息：
申购主题：小鼠全基因组甲基化建库测序服务
报价要求：国产含税
发票类型：增值税专用发票
付款方式：货到验收合格后付款
送货时间：合同签订后7天内送达
安装要求：免费上门安装（含材料费）
预算：146,000.00 人民币

收货地址：广东省/深圳市/南山区/****
备注说明：
采购明细：

序号	采购内容	数量/单位	预算单价	品牌	型号	规格参数	质保及售后服务	附件

1

全基因组甲基化建库测序服务

1/个

146000

illumina

1、38个自然日内完成27例小鼠样本的全基因组甲基化测序分析服务，具体包括进行DNA提取质检，质检合格后，进行全基因组甲基化建库，使用illumina 平台进行PE150测序，每个样本测序数据量不低于48G，并完成相应的生物信息分析； 2、投标人拥有illumina平台25台以上，拥有分析平台进行甲基化数据分析。 3、基本分析 1)数据基本处理与质控； 2)甲基化位点检测； 3)全基因组甲基化水平分析； 4)甲基化C碱基中CG,CHG与CHH的分布比例； 5)C位点甲基化水平分析； 6)甲基化CG、CHG和CHH的甲基化水平分布； 7)甲基化位点IGV可视化； 8)样本甲基化密度circos图； 9)样本不同序列环境（CpG、CHH、CHG）甲基化水平密度circos图； 10)基因各功能区域（如promoter，exon，intron，CGI，CGIshore，repeat等）甲基化水平分布； 11)在各种genebody、TSS（转录起始位点）上游2K、TES（转录终止位点）下游2K的平均甲基化水平分布； 12)样本相关性PCA分析和样本间功能区域甲基化水平进行热图分析； 13)甲基化水平差异circos图； 14)功能区域甲基化水平分布比较作图； 15)组合间基因上下游甲基化水平分布比较作图； 16)全基因组差异甲基化区域DMR的检测； 17)DMR相关基因KEGG分析； 18)DMR锚定promoter基因富集分析； 19)DMR锚定promoter区域相关基因KEGG富集分析； 4、拥有智能化交付系统，并搭载自动化样本库，以确保项目能高效准确智能化的开展； 5.样本运输和储存专项方案科学合理，能完全满足采购人需求；

知识产权：双方确定，本项目不论是单方独立完成或双方合作完成的与合作项目有关的阶段性、最终科研成果及相关知识产权权利归甲方所有。