公告摘要
项目编号中大招(货)[2023]040号
预算金额-
招标公司中山大学
招标联系人-
标书截止时间-
投标截止时间-
公告正文
中山大学生命科学学院高性能计算服务器采购项目
基本信息
项目编号 中大招(货)[2023]040号
项目名称 中山大学生命科学学院高性能计算服务器采购项目
项目类型 货物采购 申购主题 服务器 采购单位 中山大学
项目预算 ***
采购开始时间 2023-04-26 11:36 
采购结束时间 2023-05-02 09:00 
是否送货
期望收货时间 合同签订后30天交货 经办人 罗老师 经办人电话 84111301
送货地址 广州市海珠区新港西路中山大学生命科学楼2号楼704
电子签章 本项目需要使用CA签字 CA操作手册下载
备注 1、国内供货请报含税人民币价;境外供货(进口)请报免税人民币价或外币价,报免税人民币价的公司必须有境外人民币收款账户。 2、进口货物中如有国内供货部分,供应商在报价时应分别报价,境外供货部分、国内供货部分的币种选择见第1条,并分别签订进口货物采购合同和国内采购合同。 3、本项目学校不收取任何费用, 外贸代理费由供应商支付。4、本项目需要使用CA证书,请供应商根据指引(http://bidding.sysu.edu.cn/article/4902)提前办理CA证书。 5、技术参数中如标注有“★”号的条款必须实质性响应,负偏离(不满足要求)将导致报价无效。

设备列表
采购设备 数量 参考品牌 详细响应要求
服务器 1台 【景派】 【浪潮】 【曙光】 详情请进入系统查看
"服务器"技术要求
序号 技术要求内容 评分等级 是否需要附件说明
1 (一)主机参数
1.管理登录节点1台
1) 规格:2U机架式服务器;
2) 内存:不低于12根16GB ECC DDR4-2933;
3) 存储:≥2块960GB SATA SSD硬盘,≥4块16TB SATA 7.2K rpm硬盘;
4) 阵列卡:≥1块带缓存独立RAID卡,支持RAID 0,1,10,5,6,50,60;
5) 电源模块:≥2 个(1+1)热插拔冗余电源,输出功率≥800W;
重要
2 6) ★处理器:性能不低于2颗Intel Xeon Gold CPU(单颗主频≥2.5GHz、核心数≥20个); 非常重要
3 7) 网络: 不低于4个千兆网口,1个IPMI远程管理接口,1个单端口100Gb OPA网卡; 非常重要
4 8) 通过国家强制性产品认证(CCC),并提供证书扫描件或产品官网、证书查询权威网站截图证明; 非常重要
5 2. 胖节点1台
1) 规格:2U机架式服务器;
2) 存储:≥2块960GB SATA SSD硬盘;
3) 网络: 不低于1个千兆网口,1个IPMI远程管理接口,1个单端口100Gb OPA网卡;
4) 电源模块:≥2 个(1+1)热插拔冗余电源,输出功率≥1600W;
重要
6 5) ★处理器:性能不低于4颗Intel Xeon Platinum CPU(单颗主频≥2.1GHz、核心数≥28个); 非常重要
7 6) 内存:不低于32根64GB ECC DDR4-2666,最大支持48个内存插槽; 非常重要
8 7) 通过国家强制性产品认证(CCC),并提供证书扫描件或产品官网、证书查询权威网站截图证明; 重要
9 8) 系统安全:微隔离控制策略支持基于IP(组)、服务和角色维度进行配置项设置,并且支持对配置项的备份以及恢复操作 ;流量可视支持图形化显示业务系统、服务器及流量详情 (需提供产品功能截图证明 )。 非常重要
10 3. 计算节点6台
1) 规格:2U机架式服务器;
2) 网络: 不低于2个千兆网口,1个IPMI远程管理接口,1个单端口100Gb OPA网卡;
3) 电源模块:≥2 个(1+1)热插拔冗余电源,输出功率≥1300W;
重要
11 4) ★处理器:性能不低于2颗Intel Xeon Platinum第三代可扩展处理器(单颗主频≥2.9GHz、核心数≥32个,缓存≥54MB); 非常重要
12 5) 内存:不低于8根64GB ECC DDR4-3200,最大支持32个内存插槽; 非常重要
13 6) 存储:≥2块960GB SATA SSD硬盘,最大支持12 LFF硬盘槽位,支持SAS/SATA/NVMe接口; 非常重要
14 7) 通过国家强制性产品认证(CCC),并提供证书扫描件或产品官网、证书查询权威网站截图证明; 非常重要
15 4. 元数据服务器1台
1) 规格:2U机架式服务器;
2) 内存:不低于4根16GB ECC DDR4-2933;
3) 阵列卡:≥1块带缓存独立RAID卡,支持RAID 0,1,10,5,6,50,60;
4) 网络: 不低于4个千兆网口,1个IPMI远程管理接口,1个单端口100Gb OPA网卡;
5) 电源模块:≥2 个(1+1)热插拔冗余电源,输出功率≥800W;
重要
16 6) ★处理器:性能不低于2颗Intel Xeon Gold CPU(单颗主频≥2.5GHz、核心数≥20个); 非常重要
17 7) 存储:≥2块240GB M.2 SATA SSD硬盘, ≥4块960GB SATA SSD硬盘; 非常重要
18 8) 通过国家强制性产品认证(CCC),并提供证书扫描件或产品官网、证书查询权威网站截图证明; 非常重要
19 5. 存储服务器2台
1) 规格:4U机架式服务器;
2) 内存:不低于4根16GB ECC DDR4-2933;
3) 阵列卡:≥1块带缓存独立RAID卡,支持RAID 0,1,10,5,6,50,60;
4) 网络: 不低于4个千兆网口,1个IPMI远程管理接口,1个单端口100Gb OPA网卡;
5) 电源模块:≥2 个(1+1)热插拔冗余电源,输出功率≥800W;
重要
20 6) ★处理器:性能不低于2颗Intel Xeon Gold CPU(单颗主频≥2.5GHz、核心数≥20个); 非常重要
21 7) 存储:≥2块240GB M.2 SATA SSD硬盘, ≥24块16TB SATA 7.2K rpm硬盘; 非常重要
22 8) 通过国家强制性产品认证(CCC),并提供证书扫描件或产品官网、证书查询权威网站截图证明; 非常重要
23 6. 千兆交换机1台
1) 提供≥24个千兆电口,≥4个千兆光口,交换容量≥336Gbps,包转发率≥108Mpps;
重要
24 2) 提供本次项目所需的配套线缆及光模块,投标时提供承诺函。 重要
25 7. 高速网络交换机1台
1) 提供≥48个100Gb/s 端口;
2) ≥1.2TB/s 交换机吞吐量;
3) 提供≥11条配套线缆,带光模块。
重要
26 (二)附件参数:
1. 另提供≥3个10A国标机柜PDU
2. 另配备≥13套上架导轨3. 另配备≥13套线缆4. 另提供≥1根 16GB ECC DDR4-2933内存
5. 另提供≥2根 164GB ECC DDR4-2666内存6. 另提供≥1块 960GBSSD硬盘
7. 另提供≥1块16TB SATA 7.2K rpm硬盘
重要
27 (三)软件及其功能:
1. 正版管理软件:
能提供用户管理、资源调度、实时监控等。具体包含以下功能:(1)权限管理:设置用户的CPU、内存、磁盘配额等。(2)资源调度:强大的资源调度策略。调度任务时,可以指定CPU数、内存数等,以及输入输出(I/O)目录、可执行文件和命令参数等。提高资源利用率,并实现计算任务的高可用性。(3)高效任务提交:支持用户在线提交任务和Shell脚本启动任务,以及查看任务运行状态及资源消耗情况。(4)Restful接口服务:提供Restful API二次开发服务。
2. 分布式文件管理系统
3. 公有云管理控制系统
4. 安全管理系统:
微隔离控制策略支持基于IP(组)、服务和角色维度进行配置项设置,并且支持对配置项的备份以及恢复操作 ;流量可视支持图形化显示业务系统、服务器及流量详情。(提供产品官网网页或功能截图等证明);
5. 安装配置常见生物信息数据库:NCBI-NR、NCBI-NT、Uniprot/Swissprot、Pfam、Silva、GreenGenes database ,RDP database、checkmdb、uniref、accession2taxid等
6. 安装配置完成微生物基因组、宏基因组、转录组、代谢组、比较基因组、扩增子等所需要的生信工具,包括但不限于以下几个方面:1.序列/制表符等文件的通用数据处理工具;2.基因组注释类工具, 完成基因预测、功能注释、基因家族分析;3.基因组组装类工具,可完成二代/三代微生物基因组、宏基因组组装;4.宏转录组数据分析等相关工具;5.扩增子数据分析工具;支持LatentStrainAnalysis的安装运行,使用去卷积算法识别隐藏变量的散列k-mer簇,将k-mer abundance矩阵的流奇异值分解(SVD)在固定内存中操作,利用两组潜在的正交向量聚类kmers进行reads区分,降低对数十甚至数百GB的宏基因组数据集组装过程对TB内存的依赖,集群hash kmer计数时间小于30分钟。软件包括但不限于以下列表
abawaca fqtrim metaeuk samblaster abawaca fqtrim metaeuk-6.0 samblaster abricate-1.0.1 FragGeneScan-1.31 MetaGeneAnnotator samclip-0.4.0 abricate-1.0.1 FragGeneScan-1.31 MetaGeneAnnotator samclip
actc-0.3.1 FragGeneScanPlus-4bc9442 MetaGeneAnnotator samtools-1.16.1 actc-0.3.1 FragGeneScanPlus MetaGeneAnnotator samtools-
bcftools-1.16 gofasta-1.1.0 NextPolish-1.4.1 snoscan-1.0 bcftools-1.16 gofasta-1.1.0 NextPolish-1.4.1 snoscan-1.0
bedtk-0.0-r25 goleft-0.2.4 ngmlr-0.2.7 snp-dists-0.8.2 bedtk-0.0-r25 goleft-0.2.4 ngmlr-0.2.7 snp-dists-0.8.2
bedtools-2.30.0 GOTTCHA-1.0c fqgrep-0.4.4 snpEff-5.1 boost-1.75.0 hifiasm-meta-0.3 OrthoFinder-2.5.4 pbmm2-1.10.0
clustalw-2.1 jellyfish-1.1.12 pilercr-1.06 taxonkit-0.14.0 delly-1.1.6 kgrep-0.7.0 prodigal-2.6.3_1 delly-1.1.6
cmake-3.25.1 jellyfish-2.3.0 pilon-1.24 tbl2asn-25.8 diamond-0.9.36 KMC-3.2.1 prokka-1.14.6 diamond-0.9.36
CONCOCT-1.1.0 k8-0.2.5 pizzly-0.37.3 tiwih-0.1.9 diamond-2.0.15 kraken-1.1.1 protoc-21.12 diamond-2.0.15
fastspar-1.0.0 MeCorS-0.4.1 Rockhopper-2.0.3 ViennaRNA-2.5.1 dist_est-1.1 KronaTools-2.8.1 ps_scan-2.3 trimal-1.4.1
FastTree-2.1.11 MEGAHIT-1.2.9 root-6.26.10 viralVerify-1.1 dmd-2.101.2 lastz-1.04.22 psort-1.0 TrimGalore-0.6.7
fetchMG-1.0 MEGAN-CE-6.24.16 RSEM-1.3.3 VirSorter2-2.2.3 echtvar-0.1.7 LCA-0.23 pullseq-1.0.2 Trimmomatic-0.39
Filtlong-0.2.1 meme-4.11.2 ruby-3.2.0 VizBin-0.9 edyeet-0.3 libdivsufsort-2.0.1 FLASH-1.2.11 Trinity-2.15.0
7. 配置安装python、perl、R语言,包含但不不限于以下列表
App::cpanminus File::Which SVG Convert::Binary::C JSON::PP Test::Needs Devel::GlobalDestruction namespace::clean
Array::Utils Getopt::Long Switch CPAN::Meta List::MoreUtils Test::Pod Devel::OverloadInfo Number::Compare
B::Hooks::EndOfScope Graph Test::CleanNamespaces CPAN::Meta::Check List::Util Test::Requires Devel::StackTrace OLE::Storage_Lite
Capture::Tiny Graph::ReadWrite Test::Deep CPAN::Meta::YAML Log::Log4perl Test::Simple Digest::Perl::MD5 Package::DeprecationManager
Class::Data::Inheritable HDB Test::Exception Crypt::RC4 Module::Implementation Test::Warn Dist::CheckConflicts Package::Stash
Class::HPLOO HTML-TableExtract Test::Fatal Cwd Module::Metadata Test::Warnings Encode Package::Stash::XS
Class::Load IO::String Test::Harness Data Module::Runtime::Conflicts Text::CSV Eval::Closure Params::Util
Class::Load::XS IO::Stringy Test::Most Data::OptList Moose Text::Glob Exception::Class Parse::Yapp
attrdict lvm python-nss biopython matplotlib pywbem coverage numpy
backports.shutil-get-terminal-size lxml python-yubico blivet mock pyxattr cryptography openlmi
backports.ssl-match-hostname M2Crypto pytz brewer2mpl mongoengine PyYAML cupshelpers pandas
Beaker Magic-file-extensions pyudev Brlapi mykatlas qcli custodia Paste
biom-format Mako pyusb burrito mykrobe qiime cycler pathlib
biome MarkupSafe PyVCF burrito-fillings MySQL-python qiime-default-reference Cython pathlib2
abind cellranger doParallel gdata graph Cairo diffobj fs
ANCOMBC checkmate doRNG gdtools graphics callr digest futile.logger
annotate class DOSE genefilter graphlayouts car DirichletMultinomial futile.options
AnnotationDbi cli downlit geneLenDataBase grDevices carData distributional future
AnnotationForge clipr downloader geneplotter grid castor dlstats future.apply
ape cluster dplyr generics gridExtra Category docopt gapminder
aplot clusterProfiler dqrng GenomeInfoDb gridGraphics caTools doMC gargle
arm coda dtplyr GenomeInfoDbData gridSVG labeling optparse RColorBrewer
重要
28 (四)配置清单:
1. 管理登录节点 1台
2. 胖节点 1台
3. 计算节点 6台
4. 元数据服务器 1台
5. 存储服务器 2台
6. 千兆交换机 1台
7. 高速网络交换机 1台
8. 另配备≥3个国标机柜PDU9. 另配备≥13套上架导轨10. 另配备≥13套线缆11. 另配备≥ 1根16GB ECC DDR4-2933内存12. 另配备≥2根64GB ECC DDR4-2666内存13. 另配备≥1块960GB SSD硬盘14. 另配备≥1块16TB SATA 7.2K rpm硬盘15. 正版管理软件 1套
16. 分布式文件管理系统 1套
17. 公有云管理控制系统 1套
18. 安全管理系统 1套
19. 生物信息数据库 (见软件及其功能第5项) 1套
20. 生信工具(见软件及其功能第6项) 1套
21. python、perl、R语言(见软件及其功能第7项) 1套
重要
29 (五)培训要求:
免费在现场对采购方技术人员进行设备操作培训,保证使用方人员能够熟练掌握各种设备和软件等常规使用方法,熟练地管理设备,熟练地进行故障检测和故障分析,让使用相关设备人员能够熟练使用相关设备的大部分功能。
重要


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