申请小鼠组织检测DNA甲基化修饰情况(2次竞价)
竞价结果(JJ22051210160224)
开始时间：2022-05-17 11:07:45 截止时间：2022-05-20 11:07:45 截止时间已过
成交单位：上海伯豪生物技术有限公司
成交价：
69300.00元
说明：各有关当事人对竞价公告内容有异议的，可以在竞价截止时间前通过规定途径提起异议，逾期将视为无异议，不予受理。

采购单位：广州体育学院	联系人：范
E-mail：tycgzx602@163.com	联系电话：38027663
传真：无	联系手机：无
邮编：无	平台联系电话（异议）：020-37619972；jycg001@qq.com
项目名称： 申请小鼠组织检测DNA甲基化修饰情况(2次竞价)	竞价编号：JJ22051210160224
采购类型：服务类	开始时间：2022-05-17 11:07:45
项目预算(元)：80,000.00	结束时间：2022-05-20 11:07:45

     项目名称：申请小鼠组织检测DNA甲基化修饰情况(2次竞价)

序号	产品名称	产品类别	标配	单位	数量	应标品牌	应标型号	产地	偏离说明	详情
1	小鼠组织检测DNA甲基化修饰情况	科学研究和试验开发	否	项	1.00	响应。上海伯豪生物技术有限公司采用Agilent品牌		无	无
规格配置：一、响应平台要求： 1.上海伯豪生物 技术有限公司采用Agilent 的SureSelectXT 甲基化靶向序列捕获平台（Methyl-Seq)，基于杂交捕获的靶向序列捕获技术利用探针选择 NGS 文库中的目标序列。 2.技术参数：小鼠，109Mb 设计长度 二、响应服务内容指标要求： 1.校方提供给供应商20例小鼠组织样本，进行测序检测分析服务。 2.供应商对上述样品进行抽提和质量检测，样品质检合格后，提供如下技术服务：完成Illumina PE建库—上机测序—原始数据（Base-calling）—数据分析（过滤接头序列数据等预处理、生物信息学分析）。 3.原始数据 i.获得原始序列数据（Base-calling）： Illumina测序提供FastQ文件 ii.数据的质量评估（QC）： iii.原始的reads数目； 三、响应分析内容指标要求： 1.原始数据预处理及数据过滤和质控： Illumina 测序：去除碱基整体质量偏低的reads，修剪3’端低质量碱基，去除测序接头序列，去除测序长度过短的reads后，保留成对的reads用于后续分析。 2.碱基转化效率评估： 哺乳动物体内非CG位点的C的甲基化比例很低接近1%,CHH和CHG的甲基化ratio值接近1%的话说明亚硫酸氢盐转化完全。 3.捕获效率评估 4.基因组比对及mapping 将经过质控的reads与参考基因组或替换基因组进行比对并mapping到正确的位置，统计mapping的比率及染色体分布等信息。 5.差异甲基化位点和区段筛选 使用fisher检验筛选差异甲基化CpG/CHG/CHH位点和甲基化区段。 6.差异甲基化位点或区段的基因注释 差异甲基化位点或区段分别在不同基因功能元件（“promoter”, “5’UTR”, “CDS”,” 3’UTR”,“Intron”和“intergenic”）中的分布。 根据差异甲基化位点与基因的位置关系，对差异甲基化位点进行基因注释。 四、响应供应商资质指标要求： 1.上海伯豪生物技术有限公司是Agilent 公司的认证服务商资质，采用稳定的SureSelect 捕获系统进行甲基化捕获。 2.我司具有丰富的表观功能机制和生物标志物筛选研究经验，帮助客户发表过多篇高分文章。3.我司同时提供高通量SureSelectXT甲基化捕获测序和低通量焦磷酸验证服务。 4.我司建立有规范化的质量控制体系，通过了 ISO9001:2015 质量技术体系的认证。
售后服务：1、响应服务交付时间、地点（1）交付要求：合同签订之日起30个工作日内，完成全部测序实验反应和数据评估；在全部测序数据评估合格后的15个工作日内完成测序数据基础生物信息学分析处理工作并交付采购人实验报告。（2）响应交货地点：广州体育学院内（采购人指定地点）2、响应知识产权和安全保密等要求