招标
齐齐哈尔医学院药物计算设计软件购置项目公告
结构处理与分析全原子结构模型多种结果结果分析骨架跃迁自定义结合位点综合比对分析虚拟筛选工作流分子表征自动化定量构效关系分析蛋白LOOP区域优化自由能计算自动生成分子动力学方法不同算法模型结构预测AI柔性搭建综合对比分析突变计算性质预测编辑突变位点小分子综合评价蛋白质结构数据增强采样方法维护相互作用能量多精度方法从头生成蛋白环区构象蛋白对接MMGB/PBSA原子映射不同类型的模型蛋白稳定性计算蛋白质结构叠合分子建模多种生成结合构象可视化分析3D结构蛋白复合物动力学的方法FEP微扰图综合评估软件升级冷冻电子显微镜一键展示置信度评估分子相似性搜索自动化参数优化虚拟化合物库构象搜索分子评价技术指导稳定性分析技术培训大环成环微扰对接位点蛋白口袋片段生长稳定性预测R基团优化深度学习算法统计分析多氨基酸基本原理能量最小化自由能微扰药物计算设计软件分子动力学模拟蛋白质折叠稳定性的影响基于深度学习关键特征PTM快速大批量筛选结构预处理可能发生翻译后修饰的位点预训练模型水分子的结合自由能及位置结构准备快速傅里叶转化相关性技术可视化标注行业应用软件工作流式筛选分子生成监控不同打分函数构建结构优化分子性质计算分子对接计算值操作使用准确性分子结构模型
金额
-
项目地址
黑龙江省
发布时间
2024/10/17
公告摘要
项目编号dzjj24101710547520
预算金额-
招标联系人张福明
标书截止时间-
投标截止时间2024/10/20
公告正文
项目名称: 齐齐哈尔医学院药物计算设计软件购置项目
项目编号: DZJJ24101710547520
项目基本信息
采购单位:齐齐哈尔医学院 报价截止时间:2024-10-20 09:00:00 项目预算(元):350000.00 联系人:张福明 送货地点:黑龙江省齐齐哈尔市建华区卜奎北大街333号齐齐哈尔医学院国有资产管理处 到货时间:合同签订后30个日历日到货 签约时间:成交公告发布后5个工作日内签署合同 仅面向中小企业:否 小微企业优惠率(%): 10.00
售后服务要求
售后服务网点: 无具体要求
免费维修质保期: 不需要 电话支持响应要求: 不需要
售后上门服务年限: 不需要
售后上门服务时限: 不需要

采购产品需求清单
序号 商品分类 产品名称 参考品牌 参考型号 计量单位 采购数量 产地要求 现货要求 原装正品要求 技术指标
1 行业应用软件 药物计算设计软件
Hermite

V2024
1 中国

1 运行模式:云端布置,浏览器登录即时在线使用;支持多账号同时运行(30个账号以上),平稳运行不卡顿。
2 数据安全:(1)信息系统安全三级备案证明;(2)具有操作权限管理和登记功能:对每个账户管理员能够执行操作登记与权限限制;(3)具有存储按次加密、科研数据保密功能与协议。
3 购买合同形式:一次性支付5年总费用不高于35万元。
无其它培训、软件升级、技术指导等任何费用。
4 运行算力:(1)一次性采购费用中,内含不低于10万元算力;(2)能够根据客户实际运行情况,根据客户需求弹性调度算力。
5 技术支持:通过微信、电话、邮件等方式提交技术支持请求,供应商需提供5*8小时电话技术支持;如遇故障,供应商在8小时以内对用户的要求予以回应,48小时内派专业技术人员解决问题。
6 技术培训:软件交付后,组织线上线下全覆盖的使用技能培训,培训内容包括基本原理、操作使用、维护等方面。
1 3D界面交互:平台支持多样的分子展示、选择和编辑功能,在使用计算功能和分析结果时,需要满足实时联动查看蛋白和小分子结构,便于用户基于整体结构进行决策和分享。
2 蛋白质结构预测:能够满足基于深度学习的蛋白质结构预测功能,从蛋白一级序列出发预测蛋白质的3D结构,提供结果的一键展示及置信度评估。
3 分子对接功能:实现快速大批量筛选,支持内置虚拟化合物库,快速完成大化学空间的虚拟筛选任务;支持不同精度的对接方法及打分函数;支持多种限制性对接方法。
4 蛋白质-小分子的结合稳定性分析:支持基于分子动力学模拟的方法衡量小分子-蛋白复合物中小分子结合构象的稳定性;支持不同方式的动力学模拟方法,包括传统分子动力学方法和增强采样方法;可实现动力学轨迹的可视化分析和结果的统计分析。
5 基于MM GB/PBSA的结合自由能计算:支持一键进行分子和蛋白的可视化与编辑、初始结构准备、FEP微扰图和原子映射的构建、计算的监控与结果分析;支持R基团优化、骨架跃迁和大环成环微扰;支持自动生成及手动修改微扰图和原子映射;可实现续算并合并分析结果等。
6 基于自由能微扰的结合自由能计算和分析:支持一键进行分子和蛋白的可视化与编辑、初始结构准备、FEP微扰图和原子映射的构建、计算的监控与结果分析;支持R基团优化、骨架跃迁和大环成环微扰;支持自动生成及手动修改微扰图和原子映射;可实现续算并合并分析结果等。
7 基于自由能微扰计算的蛋白稳定性计算:满足多氨基酸的突变计算,具备结果的可视化分析,可实现计算值与实验值的综合比对分析。
8 水分子自由能计算: 满足通过分子动力学模拟,计算得到蛋白中每个水分子的结合自由能及位置,以确定对结合影响较大的关键水分子,指导分子的设计和优化。
9 蛋白翻译后修饰位点预测:利用预训练模型,精确识别和预测蛋白质序列中可能发生翻译后修饰的位点;可实现不同PTM的可视化标注。
10 蛋白-蛋白对接:支持基于快速傅里叶转化相关性技术,计算分子间的相互作用能量和最佳对接位点;支持不同打分函数进行综合评价;支持自定义结合位点。
11 基于AI的蛋白突变稳定性预测:支持基于AI,识别蛋白质序列中的关键特征,并预测特定突变对蛋白质折叠稳定性的影响;支持批量自定义氨基酸突变位点;支持实验值与计算值的综合对比分析。
12 分子生成:可实现基于蛋白口袋的分子生成,提供多种生成方式如片段生长、从头生成;提供分子评价标准及多种结果。
13 自动化定量构效关系分析:只需输入SMILLS及其对应的属性,即可自动构建不同类型的模型,且具备自动化参数优化的功能;结合多维的分子表征方式,可提高性质预测的准确性。
14 小分子结构处理与分析:包含分子建模、能量最小化、构象搜索和分子性质计算等算法,能够对小分子进行精确结构优化和性质预测;支持结构预处理、分子相似性搜索等。
15 基于冷冻电子显微镜的结构优化功能:具备基于冷冻电子显微镜密度图的全原子结构模型柔性搭建功能,结合分子动力学模拟和深度学习算法,方便快速获得与密度图相吻合的高质量的分子结构模型。
16 能基于动力学的方法,对蛋白柔性环区结构优化,实现不同算法模型的综合评估,获得更合理的蛋白环区构象。
17 虚拟筛选工作流:整合多精度方法的虚拟筛选工作流,可实现从低精度到高精度多种计算方法;支持不同精度方法工作流式筛选
18 蛋白质结构处理与分析:能够为复杂的蛋白质结构数据提供更为全面完善的结构预处理,支持蛋白loop区域优化、蛋白质结构叠合等。

场内外比价规则:
1.所有黑龙江省政府采购网的供应商皆可参与场内外比价。
2.供应商参与报价则表示默认满足并接受采购需求项目要求。
3.所报价格不得高于采购人设定的成本价格和同期任一大型电商平台(京东、苏宁、国美)自营的在售同款商品价格,实现采购价格和采购质量最优。供应商报价可提供商品价格证明,有以下两种方式(非必填):
①①报价供应商应提供同期 1家以上大型电商平台(京东、苏宁、国美)自营的在售同款商品的参考链接、参考价格。
②可提供厂商官网同期同款商品链接或过去一年的历史合同、发票作为参考。
以上两种方式均要求报价(供货价)应不高于链接或合同中的参考价。
4.其他资质文件:
①供应商响应的若为进口商品或品牌商品,需提供生产厂家或一级经销商授权。 (品牌商品名单详见:https://hljcg.hlj.gov.cn/mall-view/information/detail?noticeId=650035)
②供应商响应的若为生产厂家自产自销商品,应提供《生产厂家自产自销商 品证明》和具有合法资质的检测机构出具的产品检测(检验)报告或证书等必要的证明。
5.如成交供应商超过72小时未确认订单,视为该供应商放弃成交,采购人可选择废标或选择其他报价供应商成交。
6.如项目关联了不专门面向中小企业的采购计划,供应商响应的所有商品均为小型或微型企业生产的,应上传《小微企业声明函》,电子卖场按照我省支持中小企业发展的相关政策,自动对该供应商的报价给予规定比例的价格扣除,用扣除后的价格进行比价结果排名,实际成交价为未扣除价格前的供应商响应报价。

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