项目名称:22个杉木样本全转录组测序及分析服务
项目编号:ZXCG-JJ-220066
采购单位:
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预 算: ￥ 93000
供应商资质要求: 符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件
采购商品:22个杉木样本全转录组测序及分析服务
采购数量:1
计量单位:批
所属分类:软件开发服务
品牌:无
型号:无
技术参数及配置要求:1. 杉木样本全转录组建库测序：
1.1 完成22个杉木样本的RNA提取。RNA样本质检结果要求：RIN（RNA完整系数）≥7.0 且28s/18s>=0.7，总量≥2μg，浓度≥50 ng/ul，无真核或原核生物污染；无DNA或蛋白污染；无过多的5s rRNA；如个别样本不能满足后续实验需求，免费重新抽提质检；
1.2 基于Illumina测序平台，利用双末端测序的方法，构建22个杉木样本的去除核糖体RNA的链特异性文库并测序，同时获得mRNA、lncRNA和circRNA三种类型的RNA测序数据。全转录组测序质量要求：
1.2.1 采用二代高通量测序平台进行150bp paired-end测序，保证使用测序设备原厂试剂完成建库和测序工作，每个样本可用reads的总碱基量大于10G；
1.2.2 保证每个样本 Q20>90%，碱基类型分布均匀；
1.2.3 服务周期：45个工作日。
2. 杉木样本的全转录组分析：
2.1 完成22个杉木样本的全转录组数据分析，主要分析内容包括：
2.1.1 测序数据质控；
2.1.2 参考基因组比对；2.1.3 基因表达定量分析；
2.1.4 基因差异表达分析；
2.1.5 差异表达基因GO & KEGG富集分析；
2.1.6 蛋白网络互作分析；
2.1.7 可变剪接分析；
2.1.8 SNP/INDEL分析；
2.1.9 新转录本预测及基因结构优化；
2.1.10 lncRNA/circRNA与mRNA共表达网络分析。
2.2 服务周期：15个工作日。
3. 杉木样本的差异基因表达分析验证：
3.1 利用荧光定量PCR技术对22个杉木样本的mRNA测序结果进行验证；
3.2 利用数字PCR技术对22个杉木样本的lncRNA和circRNA测序结果进行验证；
3.3 服务周期：8个工作日。
4. 其它要求：
4.1 所获得的数据成果所有权归采购人所有；
4.2 中标人需与采购人充分沟通样品制备、保存及运输方式以使项目顺利进行。
售后服务:服务年限:质保期一年;

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