汕头大学医学院-竞价公告(CF1056Y2022000096)

公告摘要

项目编号cf1056y2022000096

预算金额9.8万元

招标公司汕头大学医学院

招标联系人-

标书截止时间-

投标截止时间-

公告正文

汕头大学医学院-竞价公告(CF1056Y2022000096)

发布时间：2022-11-04 08:55:28
截止时间：2022-11-07 08:05:13
申购单号：CF1056Y2022000096 签约时间：发布竞价结果后7天内签约合同
申购主题：病理样本检测分析服务送货时间：合同签订后7天内送达
采购单位：汕头大学医学院安装要求：免费上门安装（含材料费）
报价要求：国产含税收货地址：广东省/汕头市/金平区/****
发票类型：增值税普通发票
币种：人民币
预算：98000.0
付款方式：货到验收合格后付款
备注说明：
申购明细：
序号：1
采购内容：病理样本检测分析服务
数量：1
预算单价：项
品牌：
型号：
规格参数：见附件
质保及售后服务：见附件
附件：附件：实验方案-10.26.docx 附件：实验方案-10.26.docx

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技术要求：4.做QRCR,WB,免疫组化等相关实验进行可能致使白癜风的基因验证。3.分析获得数据结果2.把皮肤样本送到公司做12例普通转录组，1例单细胞测序，46例外显子测序1.采集白癜风患者皮肤样本一、实验内容

1.5.有效Barcode统计，测序饱和度统计；1.4.转录组分析内容：1.3.每个文库可供分析的有效数据需达到150G1.2.测序质量要求：10Xgenomics文库质检合格后，测序Q20＞90%,Q30>85%；1.1.基于10Xgenomics单细胞平台，利用双末端测序（Paired-End）的方法，完成1个样本的单细胞核转录组测序分析。可供分析的有效数据需达到150G10Xgenomic单细胞核转录组测序与分析：

2.1.marker基因筛选；2.0.差异基因功能富集，包括GO和KEGG、Reactome；1.9.差异基因分析，针对不同cluster中的基因进行差异分析；1.8.聚类分析，提供tSNE聚类分析结果；1.7.基因表达定量，获得表达基因及其表达量数据；1.6.基本数据分析，细胞数目统计，单个细胞reads数目统计等；

外显子测序与分析：2.6.项目周期：从样本制备到标准分析结果交付不超过14个自然日2.5.每个实验需要提供明细实验步骤和结果，包括所有测序原始数据，生物信息学数据分析；如因供应商原因导致项目失败，如服务或产品质量不合格等，供应商承担全部责任并退还付款；2.4.其他个性化分析（甲方要求的个性化分析）2.3.蛋白互作网络；2.2.转录因子注释；

2.6.高频突变分析（＞2对样本）2.5.SomaticSNV/InDel检测、注释及统计2.4.聚类分析样本间一致性2.3.与参考序列进行比对、统计测序深度及覆盖度2.2.数据质控：去除接头污染和低质量数据2.1.基于Illumina技术测序平台，利用双末端测序（Paired-End）的方法，完成46例白癜风患者皮肤组织的外显子测序分析。

3.2.对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads的处理，3.1.基于Illumina技术测序平台，利用双末端测序（Paired-End）的方法，完成12例转录组测序分析转录组测序分析：2.9.突变频谱分析2.8.高频突变基因富集分析2.7.高频突变基因统计

三、公司资质：3.7.主成分分析3.6.样本间基因表达水平的相关性分析(＞=2个样本)3.5.基因表达水平分析3.4.参考序列比对分析以基因组为参考序列，需提供基因组链接、基因组结构注释文件和功能注释文件3.3.数据产出统计及测序数据的成分和质量评估

公司需具有成熟的管理和服务体系，具备标准的生产流程、完善的质控体系及高素质的检验人员，通过ISO9001质量管理体系认证、IlluminaCSPro认证。与国内外高水平科研机构有广泛合作经验，并有高质量的基因组、转录组、蛋白组及多组学相关的发表文章积累。有大数据分析的核心技术能力及经验，能够满足甲方的后续个性化分析需求。自建中国健康人数据库，包含2000以上的WES数据和500以上的WGS数据。拥有智能化交付系统，并搭载自动化样本库，以确保项目能高效准确智能化的开展。