招标
成都华西精准医学产业技术研究院有限公司乳腺超声影像、文本及病理综合数据治理系统项目比选公告
金额
48.5万元
项目地址
四川省
发布时间
2021/03/08
公告摘要
公告正文
成都华西精准医学产业技术研究院有限公司
乳腺超声影像、文本及病理综合数据治理系统项目
比选公告
根据业务需要,成都华西精准医学产业技术研究院有限公司按照公开、公平、公正原则,通过比选方式,择优选择一家设备服务商,提供乳腺超声影像、文本及病理综合数据治理系统项目服务。现将有关事项公告如下:
一、基本情况
成都华西精准医学产业技术研究院有限公司(以下简称“公司”)于2017年5月27日在成都市天府新区正式注册成立。公司由四川大学华西医院牵头建设,华西医院指定四川华西健康科技有限公司,成都市政府指定成都科技服务集团有限公司,两方共同出资成立。
二、项目概况
2.1项目名称:成都华西精准医学产业技术研究院有限公司采购乳腺超声影像、文本及病理综合数据治理系统项目服务。
2.2 项目要求
(1)项目背景
人工智能近几年成为各领域的关注的焦点,其中深度学习的提出带来了一系列革命性的变化,随着视觉向深度学习的过渡以及硬件和大数据的进步,相关的模型算法甚至达到比人眼更高的识别准确率,这为影像的发展提供了巨大的契机,超声医学作为影像领域的重要分支,利用AI相关算法进行声像图分析的研究不断涌现,不仅为临床科研提供了新思路,亦有助于提高超声诊断的准确性。
该系统基于前期乳腺超声影像,超声文本及病理文本等多源异构数据整合的结构化数据库提供大量的基础数据,通过采用自然语言特征提取,结合专家规则系统分别对乳腺超声、病理等文本数据进行结构化处理,生成标准的医用标注数据,通过自开发的图像标注工具,构建具有多维度标签的图像数据集,为医学影像人工智能研究提供高质量数据。
(2)项目需求
为满足乳腺疾病临床研究,进一步对乳腺超声及病理数据深度挖掘,要求系统具有以下核心功能:
数据解析:要求实现对超声报告(超声检查类型、报告描述、诊断意见等)、病理报告(病理检查类型、检查所见、病理诊断、免疫组化等)内容进行高准确率解析并最终输出标准化、结构化的数据,同时需要支持指定集合数据或采样数据解析需求。(注:此部份涉及规则验证和标注验证工作,开发过程要求能提供不少于5次的解析算法更新,并可到现场进行具体算法讨论。)
解析审核:针对各种数据的解析结果能提供合理的质控审核流程,可对解析数据进行人工修正作为金标准数据,供后续研究使用。
数据关联:根据研究需求,可批量对超声影像、超声报告、病理报告等多源异构数据进行自定义智能关联,生成关联后的结构化数据,记录关联历史并生成关联报告。
数据标注:提供人工对乳腺超声图像进行筛选及标签标注的功能,可实现超声及病理的解析结构化数据与超声图像的多维度、多规则关联,并能通过标签检索、查看及导出图像和报告数据。
可视化:制作数据看板功能,能进行多场景、多维度的数据查看,包含基础数据统计,解析结果分析等图表展示。
定制化检索:可根据数据库已有数据字段进行定制化关联检索并生成基础的统计分析图表数据,其中包含图像信息的部份需要按照特定规则进行结构化处理后导出。
(3)需求目标
Ø 实现对原始数据库分类查询功能;
Ø 实现对原始数据的智能批量化管理;
Ø 实现对超声,病理等非规则数据进行自动化解析;
Ø 实现对解析结果可视化管理;
Ø 提供超声影像的标签标注功能,并提供对标注数据可视化管理;
Ø 提供超声图像的结构化报告导入、填写功能,并提供检索功能;
Ø 实现对复杂规则进行数据采样分析,并支持导出;
Ø 能够满足项目的角色管理、权限管理需求。
(4)需求分析
模块结构:
部署硬件资源(已有)
(1) 软件资源包含:
服务器操作系统:Linux64
数据库: MySQL5.5
高速缓存: Redis4
队列服务:ActiveMQ
HTTP服务器:Nginx、Tomcat
搜索引擎:Elasticsearch
应用开发语言:Java、Python、JavaScript(vue3)
(2) 技术架构
(3) 技术参数
系统应遵循国际标准Java库、标准SQL等进行开发,从而提供与平台无关的特性。使得其可以在目前主流的UNIX、Windows Server、Linux操作系统,Oracle、SQL Server、Mysql、DB2等数据库, Nginx, Tomcat等标准web应用服务器平台运行。
数据系统是支持业务的所有存储数据与管理对象的集合。系统应在展示页面提供对病人数据的脱敏处理。
(4) UI及交互设计原则
简易性:界面的简洁是要让用户便于使用、便于了解产品,并能减少用户发生错误选择的可能性。
记忆负担最小化:在设计界面时必须要考虑人类大脑处理信息的限度。人类的短期记忆有限且极不稳定,24小时内存在约25%的遗忘率。所以对用户来说,浏览信息要比记忆更容易;
一致性:它是每一个出色界面都具备的特点。界面的结构必须清晰且一致,风格必须与产品内容相一致。
从用户习惯考虑:想用户所想,做用户所做。用户总是按照他们自己的方法理解和使用。通过比较两个不同世界(真实与虚拟)的事物,完成更好的设计。
安全性:用户能自由的作出选择,且所有选择都是可逆的。在用户作出危险的选择时有信息介入系统的提示。
灵活性:简单来说就是要让用户方便的使用,但不同于上述。即互动多重性,不局限于单一的工具。
布局合理化原则:在进行UI设计时需要充分考虑布局的合理化问题,遵循用户从上而下,自左向右浏览、操作习惯,避免常用业务功能按键排列过于分散,以造成用户鼠标移动距离过长的弊端。多做“减法”运算,将不常用的功能区块隐藏,以保持界面的简洁,使用户专注于主要业务操作流程,有利于提高软件的易用性及可用性。
系统操作合理性原则:尽量确保用户在不使用鼠标(只使用键盘)的情况下也可以流畅地完成一些常用的业务操作,各控件间可以通过Tab键进行切换,并将可编辑的文本全选处理。
查询检索类页面,在查询条件输入框内按回车应该自动触发查询操作。
在进行一些不可逆或者删除操作时应该有信息提示用户,并让用户确认是否继续操作,必要时应该把操作造成的后果也告诉用户。
信息提示窗口的“确认”及“取消”按钮需要分别映射键盘按键“Enter”和“ESC”。
避免使用鼠标双击动作,不仅会增加用户操作难度,还可能会引起用户误会,认为功能点击无效。
表单录入页面,需要把输入焦点定位到第一个输入项。用户通过Tab键可以在输入框或操作按钮间切换,并注意Tab的操作应该遵循从左向右、从上而下的顺序。
系统响应时间原则:系统响应时间应该适中,响应时间过长,用户就会感到不安和沮丧,而响应时间过快也会影响到用户的操作节奏,并可能导致错误。因此在系统响应时间上坚持如下原则:
2-5秒窗口显示处理信息提示,避免用户误认为没响应而重复操作;5秒以上显示处理窗口,或显示进度条;一个长时间的处理完成时应给予完成警告信息。
2.3 资金预算(最高限价):485000元
2.4 资金来源:成都市财政经费。
三、比选申请人资格要求
参与本次比选系统服务商需符合以下条件:
(一)在中华人民共和国境内注册,遵守国家相关的法律法规政策,信誉良好,近三年无重大事故和不良行为记录;
(二)具有独立法人资格,具有企业法人营业执照、组织机构代码证和税务登记证(三证合一的提供营业执照);
(三)在成都设有售后服务和技术支持团队。
四、比选办法
本项目按照国家政府采购相关政策,采用“综合评分法”,由比选委员会对通过资格审查的比选申请人,按照评分由高到低的顺序,确定1—3名中选候选人。
五、比选材料领取截止时间及地点
凡有意且满足申请人资格要求的,请于2021年3月8日至2021年3月12日(上午8时30分至12时00分,下午14时00分至17时30分),可通过以下两种方式领取比选文件。
一种:上门领取。请出具单位介绍信及身份证原件及复印件、企业营业执照副本原件及复印件到成都市天府新区正兴街道湖畔路北段715号数智谷7号楼)领取。
二种:电子邮件发送。请将单位介绍信、身份证复印件、及企业营业执照副本复印件加盖公司鲜章后扫描发送至邮箱hxjzcyyhr@163.com,通过我司审核的单位,我司将于3个工作日内予以回复。
注意:请务必按比选文件要求准备并提交参选材料,逾期未领取比选材料或未提交参选材料的,视为无参与比选意向或放弃参选。本次比选不收取任何费用,参选机构准备比选文件、出席比选会的交通费等费用由参选机构自理。
六、 发布公告的媒介
四川大学华西医院(http://www.wchscu.cn/)
成都华西精准医学产业技术研究院有限公司(http://www.hxjzyx.com/)
乳腺超声影像、文本及病理综合数据治理系统项目
比选公告
根据业务需要,成都华西精准医学产业技术研究院有限公司按照公开、公平、公正原则,通过比选方式,择优选择一家设备服务商,提供乳腺超声影像、文本及病理综合数据治理系统项目服务。现将有关事项公告如下:
一、基本情况
成都华西精准医学产业技术研究院有限公司(以下简称“公司”)于2017年5月27日在成都市天府新区正式注册成立。公司由四川大学华西医院牵头建设,华西医院指定四川华西健康科技有限公司,成都市政府指定成都科技服务集团有限公司,两方共同出资成立。
二、项目概况
2.1项目名称:成都华西精准医学产业技术研究院有限公司采购乳腺超声影像、文本及病理综合数据治理系统项目服务。
2.2 项目要求
(1)项目背景
人工智能近几年成为各领域的关注的焦点,其中深度学习的提出带来了一系列革命性的变化,随着视觉向深度学习的过渡以及硬件和大数据的进步,相关的模型算法甚至达到比人眼更高的识别准确率,这为影像的发展提供了巨大的契机,超声医学作为影像领域的重要分支,利用AI相关算法进行声像图分析的研究不断涌现,不仅为临床科研提供了新思路,亦有助于提高超声诊断的准确性。
该系统基于前期乳腺超声影像,超声文本及病理文本等多源异构数据整合的结构化数据库提供大量的基础数据,通过采用自然语言特征提取,结合专家规则系统分别对乳腺超声、病理等文本数据进行结构化处理,生成标准的医用标注数据,通过自开发的图像标注工具,构建具有多维度标签的图像数据集,为医学影像人工智能研究提供高质量数据。
(2)项目需求
为满足乳腺疾病临床研究,进一步对乳腺超声及病理数据深度挖掘,要求系统具有以下核心功能:
数据解析:要求实现对超声报告(超声检查类型、报告描述、诊断意见等)、病理报告(病理检查类型、检查所见、病理诊断、免疫组化等)内容进行高准确率解析并最终输出标准化、结构化的数据,同时需要支持指定集合数据或采样数据解析需求。(注:此部份涉及规则验证和标注验证工作,开发过程要求能提供不少于5次的解析算法更新,并可到现场进行具体算法讨论。)
解析审核:针对各种数据的解析结果能提供合理的质控审核流程,可对解析数据进行人工修正作为金标准数据,供后续研究使用。
数据关联:根据研究需求,可批量对超声影像、超声报告、病理报告等多源异构数据进行自定义智能关联,生成关联后的结构化数据,记录关联历史并生成关联报告。
数据标注:提供人工对乳腺超声图像进行筛选及标签标注的功能,可实现超声及病理的解析结构化数据与超声图像的多维度、多规则关联,并能通过标签检索、查看及导出图像和报告数据。
可视化:制作数据看板功能,能进行多场景、多维度的数据查看,包含基础数据统计,解析结果分析等图表展示。
定制化检索:可根据数据库已有数据字段进行定制化关联检索并生成基础的统计分析图表数据,其中包含图像信息的部份需要按照特定规则进行结构化处理后导出。
(3)需求目标
Ø 实现对原始数据库分类查询功能;
Ø 实现对原始数据的智能批量化管理;
Ø 实现对超声,病理等非规则数据进行自动化解析;
Ø 实现对解析结果可视化管理;
Ø 提供超声影像的标签标注功能,并提供对标注数据可视化管理;
Ø 提供超声图像的结构化报告导入、填写功能,并提供检索功能;
Ø 实现对复杂规则进行数据采样分析,并支持导出;
Ø 能够满足项目的角色管理、权限管理需求。
(4)需求分析
序号 | 功能 | 内容 | 详情 |
1 | 数据源 | 数据源管理 | 提取“超声及病理综合数据库标准化治理系统”的标准原始数据作为本系统的数据来源。 |
2 | 数据解析 | 超声文本解析算法 | 解析乳腺超声报告(基本信息、超声描述、超声诊断)为结构化报告 |
病理文本解析算法 | 解析乳腺病理报告(基本信息、检查所见、病理诊断)为结构化报告 | ||
解析模型构建 | 提供用户在已有解析字段下新增解析关键词,自动完善解析词典、原始数据预处理,生成自然语言处理输入数据源、最终完成解析模型构建。 | ||
解析标注 | 提供解析标注工具,并提供系统化支撑及标注工作。 | ||
解析数据入库 | 超声、病理解析的结构化数据存入数据库 | ||
定制小批量数据解析 | 采样数据进行单独解析,解析算法不变 | ||
3 | 数据核验 | 核验流程,状态管理 | 人工对照原始数据验证解析结果,可填写结构化字段作为标准结果 |
核验数据详情 | 原始报告、解析结果和人工核验填写界面同屏显示 | ||
超声核验数据检索 | 多种类型的错误数据会自动进入核验流程,可根据数据错误类型检索待核验/已核验数据 | ||
病理核验数据检索 | |||
定制批量核验数据检索 | 可从数据库随机抽样数据进行核验 | ||
4 | 数据标注 | 生成关联数据 | 根据关联规则从多对多的超声-病理报告中,自动生成一对一的关联数据 |
关联数据检索 | 根据日期、关联ID、病理号、超声检查号等对关联数据进行检索 | ||
关联数据详情 | 整合关联的超声、病理原始数据和解析结构化数据 | ||
图像标签 | 人工筛选图像并选择结构化数据作为图像文本标签 | ||
标注任务管理 | 关联数据的领取、完成状态,强制领取他人任务进行修改等 | ||
关联数据质控管理 | 针对关联数据提供解析错误、关联错误等人工质控状态 | ||
5 | 图像标注 | 导入第三方图像标注数据源 | 导入第三方软件生成的图像标注坐标文件,标注可视化 |
图像标注数据-数据源关联 | 将坐标文件与数据库的图像相关联(文件名一致且唯一) | ||
图像标签 | 针对有标注的图像进行单独的‘数据标签-图像标签’任务 | ||
6 | 图像评估 | 导入第三方图像评估数据源 | 导入第三方生成的图像评估数据,数据维度一致进行自动关联并记录关联信息 |
图像评估流程 | 人工筛选图像,填写图像评估报告 | ||
图像评估数据检索 | 根据图像评估报告中的结构化字段检索图像及报告 | ||
7 | 数据可视化 | 大屏可视化 | 数据看板功能,能进行多维度、多场景的数据查看功能,包含基础数据统计,解析结果分析等图表展示 |
8 | 检索和导出 | 定制化检索 | 自定义检索系统,对超声、病理、图像数据等关联检索 |
定制化导出 | 自定义导出数据的字段,选择是否导出图片、及指定图像导出目录结构 | ||
9 | 操作日志 | 模块的日志处理 | 记录解析、核验、关联、标签、导出、管理用户模块的主要改动信息、人员、时间等。 |
10 | 用户管理 | 用户管理 | 新增、删除、修改、停用用户账户,配置账户的角色 |
角色管理 | 新增、修改角色,对角色配置权限——对本系统各模块的访问授权,颗粒度最小可达模块下功能页面 |
模块结构:
部署硬件资源(已有)
名称 | 备注 |
业务应用服务器 | 企业级服务器1台 |
存储服务器(数据库部署) | 普通磁盘阵列存储 |
数据解析服务器(AI模型训练) | 企业级服务器1台 |
PC工作站 | 用户接入 |
其他 | 根据需求 |
(1) 软件资源包含:
服务器操作系统:Linux64
数据库: MySQL5.5
高速缓存: Redis4
队列服务:ActiveMQ
HTTP服务器:Nginx、Tomcat
搜索引擎:Elasticsearch
应用开发语言:Java、Python、JavaScript(vue3)
(2) 技术架构
(3) 技术参数
系统应遵循国际标准Java库、标准SQL等进行开发,从而提供与平台无关的特性。使得其可以在目前主流的UNIX、Windows Server、Linux操作系统,Oracle、SQL Server、Mysql、DB2等数据库, Nginx, Tomcat等标准web应用服务器平台运行。
数据系统是支持业务的所有存储数据与管理对象的集合。系统应在展示页面提供对病人数据的脱敏处理。
(4) UI及交互设计原则
简易性:界面的简洁是要让用户便于使用、便于了解产品,并能减少用户发生错误选择的可能性。
记忆负担最小化:在设计界面时必须要考虑人类大脑处理信息的限度。人类的短期记忆有限且极不稳定,24小时内存在约25%的遗忘率。所以对用户来说,浏览信息要比记忆更容易;
一致性:它是每一个出色界面都具备的特点。界面的结构必须清晰且一致,风格必须与产品内容相一致。
从用户习惯考虑:想用户所想,做用户所做。用户总是按照他们自己的方法理解和使用。通过比较两个不同世界(真实与虚拟)的事物,完成更好的设计。
安全性:用户能自由的作出选择,且所有选择都是可逆的。在用户作出危险的选择时有信息介入系统的提示。
灵活性:简单来说就是要让用户方便的使用,但不同于上述。即互动多重性,不局限于单一的工具。
布局合理化原则:在进行UI设计时需要充分考虑布局的合理化问题,遵循用户从上而下,自左向右浏览、操作习惯,避免常用业务功能按键排列过于分散,以造成用户鼠标移动距离过长的弊端。多做“减法”运算,将不常用的功能区块隐藏,以保持界面的简洁,使用户专注于主要业务操作流程,有利于提高软件的易用性及可用性。
系统操作合理性原则:尽量确保用户在不使用鼠标(只使用键盘)的情况下也可以流畅地完成一些常用的业务操作,各控件间可以通过Tab键进行切换,并将可编辑的文本全选处理。
查询检索类页面,在查询条件输入框内按回车应该自动触发查询操作。
在进行一些不可逆或者删除操作时应该有信息提示用户,并让用户确认是否继续操作,必要时应该把操作造成的后果也告诉用户。
信息提示窗口的“确认”及“取消”按钮需要分别映射键盘按键“Enter”和“ESC”。
避免使用鼠标双击动作,不仅会增加用户操作难度,还可能会引起用户误会,认为功能点击无效。
表单录入页面,需要把输入焦点定位到第一个输入项。用户通过Tab键可以在输入框或操作按钮间切换,并注意Tab的操作应该遵循从左向右、从上而下的顺序。
系统响应时间原则:系统响应时间应该适中,响应时间过长,用户就会感到不安和沮丧,而响应时间过快也会影响到用户的操作节奏,并可能导致错误。因此在系统响应时间上坚持如下原则:
2-5秒窗口显示处理信息提示,避免用户误认为没响应而重复操作;5秒以上显示处理窗口,或显示进度条;一个长时间的处理完成时应给予完成警告信息。
2.3 资金预算(最高限价):485000元
2.4 资金来源:成都市财政经费。
三、比选申请人资格要求
参与本次比选系统服务商需符合以下条件:
(一)在中华人民共和国境内注册,遵守国家相关的法律法规政策,信誉良好,近三年无重大事故和不良行为记录;
(二)具有独立法人资格,具有企业法人营业执照、组织机构代码证和税务登记证(三证合一的提供营业执照);
(三)在成都设有售后服务和技术支持团队。
四、比选办法
本项目按照国家政府采购相关政策,采用“综合评分法”,由比选委员会对通过资格审查的比选申请人,按照评分由高到低的顺序,确定1—3名中选候选人。
五、比选材料领取截止时间及地点
凡有意且满足申请人资格要求的,请于2021年3月8日至2021年3月12日(上午8时30分至12时00分,下午14时00分至17时30分),可通过以下两种方式领取比选文件。
一种:上门领取。请出具单位介绍信及身份证原件及复印件、企业营业执照副本原件及复印件到成都市天府新区正兴街道湖畔路北段715号数智谷7号楼)领取。
二种:电子邮件发送。请将单位介绍信、身份证复印件、及企业营业执照副本复印件加盖公司鲜章后扫描发送至邮箱hxjzcyyhr@163.com,通过我司审核的单位,我司将于3个工作日内予以回复。
注意:请务必按比选文件要求准备并提交参选材料,逾期未领取比选材料或未提交参选材料的,视为无参与比选意向或放弃参选。本次比选不收取任何费用,参选机构准备比选文件、出席比选会的交通费等费用由参选机构自理。
六、 发布公告的媒介
四川大学华西医院(http://www.wchscu.cn/)
成都华西精准医学产业技术研究院有限公司(http://www.hxjzyx.com/)
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