深圳大学 - 竞价公告 (CF105902024001069)
发布时间：2024-09-03 18:43:58 截止时间：2024-09-11 12:00:00
基本信息：
申购主题：液相探针捕获甲基化测序
报价要求：国产含税
发票类型：增值税专用发票
付款方式：验收合格后付款
送货时间：签订合同后35天内交付分析报告。
安装要求：免费上门安装（含材料费）
预算：195000 人民币

收货地址：广东省/深圳市/南山区/****
供应商资质：
备注说明：
采购明细：

序号	项目名称	数量/单位	预算价	项目内容	质保及售后服务	附件

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液相探针捕获甲基化测序

1.具备文库构建测序平台，包含但不限于各类测序仪器。 2.具有分析平台，具备独立服务器，可进行液相探针捕获甲基化测序数据分析，可进行多组学数据联合分析。 3. 液相探针捕获甲基化测序技术要求： 3.1提取1ml血浆中的cfDNA样本，使cfDNA总量满足建库要求。 3.2使用液相探针捕获甲基化测序技术，针对50例cfDNA样本进行全基因组范围内CpG岛、启动子等靶区域的液相游离探针捕获，并完成甲基化测序； 3.3使用超级计算机进行测序数据过滤，并使用超级计算机分析流程进行生物信息学分析，筛选得到实验组和对照组之间的差异甲基化区域。 3.4生物信息分析要求：a.甲基化测序数据获取；b.数据质控：计算原始数据的质量（Q20和Q30），去除接头，去除低质量碱基和reads；c.数据分析：C碱基深度和覆盖度分析，C碱基的甲基化水平和测序深度统计；d.差异分析：不同组之间差异甲基化位点或者区域分析；e.其他后续定制个性化分析，包括DMR注释、GO、KEGG功能富集分析等； 4. 液相探针捕获甲基化测序交付指标： 4.1文库构建，对样品进行质检及甲基化液相探针捕获建库，对提供的血浆样本进行cfDNA提取质检，合格后通过液相游离探针捕获靶向区域，回收目的片段进行重亚硫酸盐测序; 为保证测序数据质量及分析效果，承诺以检测到基因组上的CHH位点为内参进行评估Bisulfite转化率不低于99%。 4.2测序产量，测序平台为Illumina平台，策略为PE150，每个样本获得不少于 8G raw data数据 (该数据量为甲基化数据，不包含平衡文库数据，在总数据量达标的情况下，每个样本数据量不低于目标数据量的90%，测序碱基质量值平均Q20≥90%，平均Q30≥80%)。 4.3生物信息分析要求： 1） 测序数据质量评估 2） 数据比对分析及评估 3） 甲基化位点检测及分析 4） 全基因组甲基化图谱 5） 样本间(组间)甲基化水平比较分析6） 差异甲基化分析 7）其他任何个性化分析 5.全基因组遗传关联分析芯片测序数据的知识产权归深圳大学所有。

1、验收合格之日起，免费售后服务2年；2、 技术问题解答：投标人提供免费解答项目中所涉及的任何有关上述模型定制、合成、测序、产品制备等所有该项目涉及的过程中产生的技术问题、数据分析等内容，不再另收取其他任何有关该项目的费用。若有必要，收到采购人通知24小时内，投标人需到现场进行指导培训或解答技术问题。 3、 咨询、投诉响应时间：项目进行过程中24h小时内指派合格的技术人员进行回复，其他无法迅速解决的问题，一周内解决或提出明确解决方案；采购人收到结果24小时内，发现该项目的任何问题，投标人需要将在24小时内给出解决方案，优先满足采购人实验需求。 4、 售后支持：要求投标人具有完善的售后服务队伍，及时响应采购人的服务要求。 5、 质量担保：要求所有提供的产品及检测技术均符合行业有关标准进行生产、检验合格的产品或技术，能完全满足采购人的技术要求。