招标
聊城市疾病预防控制中心高通量基因测序仪紧急采购招标邀请书公示
高通量基因测序仪控制系统全基因组测序全外显子测序表观基因组测序RNA的宏转录组测序数据DNA的宏基因组测序数据单细胞测序主流科研应用靶向基因测序基因表达谱甲基化测序主流临床应用孕前检测新生儿检测病原检测法定传染病肿瘤诊疗预防司法疾控农业原厂试剂个体识别种族区分表型区分ABO血型鉴定亲子鉴定不低于250个位点个体认定判断刻画SNP位点测序文库测序载片加载样本序列信息的收集初步分析测序试剂FastQ文件测序质量报告开机自检状态监测自动报警日志管理用户权限管理操作界面多语言耗材识别流程指导测序自定义数据安全数据清理云端数据传输参数校准常用通讯接口文库扩增PCR-Free标签跳跃基于抗体生信技术培训光学系统四色荧光检测大载片数据分析模块数据库除人源参考序列微生物鉴定来源于RefSeq的基因组序列病毒真菌寄生虫微生物基因组序列数据质控宿主数据比对RNA宏转录组DNA宏基因组测序背景微生物的干扰致病性微生物二代测序Fastq数据一键式分析鉴定报告物种鉴定后得到的总的分类信息进行DNA和RNA分析实验室信息管理系统样本制备分析报告端到端全流程解决方案服务器工作站内存固态硬盘机械硬盘以太网连接2RJ-45集成千兆局域网超薄有线键盘HP光纤有线USB鼠标有参组装进化分析基因预测变异检测毒力基因分析耐药基因分析系统进化树分析基于全基因组SNP无参组装物种树核心基因组分析并行化运算
金额
395万元
项目地址
山东省
发布时间
2022/04/08
公告摘要
项目编号-
预算金额395万元
招标联系人窦先生
标书截止时间-
投标截止时间-
公告正文
一、采购单位:聊城市疾病预防控制中心
二、采购方式:紧急采购
三、采购原则
聊城市疾病预防控制中心高通量基因测序仪紧急采购项目本着公开、公平、公正和互相信任、互利互惠的原则,由评审小组通过紧急采购方式择优遴选供应商。
四、采购内容
1、采购内容及预算:高通量基因测序仪1台,预算约为395万元。
2、交付期限:自合同签订之日起5日内供货完毕。如未按要求及时供货,每延误一天扣合同价款的1%。(负偏离其响应文件视为无效)。
3、付款方式:供货完毕验收合格后付合同价款的90%,剩余价款验收合格一年后,无质量问题一次性付清。(负偏离视为无效报价)
4、质保期:三年。
高通量基因测序仪参数
1.1.基本参数
Ÿ电源:200-240V,1200VA
Ÿ运行环境要求:温度19℃-25℃;湿度20%RH-80%RH;大气压70kPa-106kPa;海拔小于3000m
Ÿ显示屏:触控屏,中英文界面,分辨率不低于1920×1080
1.2.内置控制电脑配置
ŸCPU:Intel Xeon E5 10Core*2 2.2GHz。
Ÿ内存:不低于224GB RAM。
Ÿ机械硬盘:不低于12TB。
Ÿ固态硬盘:不低于420GB。
Ÿ测序仪控制软件:可实现中英文双语控制系统切换。
1.3.应用领域
Ÿ该产品可开展全基因组测序、全外显子测序、表观基因组测序、转录组测序、宏基因组测序、单细胞测序等科研应用。
Ÿ产品适用应用类型:
1.主流科研应用,如全基因组测序、外显子测序、靶向基因测序、全转录组测序、基因表达谱、全基因组甲基化测序、单细胞测序等。
2.主流临床应用,如产前和孕前检测、新生儿检测、病原检测、法定传染病、肿瘤诊疗和预防等。
3.其他领域,如司法、疾控、农业等方面应用。
Ÿ有原厂试剂可开展个体识别、种族区分、表型区分、ABO血型鉴定、亲子鉴定等应用。
Ÿ可同时检测不低于250个位点,涵盖个体认定、判断、刻画的SNP位点。
1.4.功能
Ÿ功能范围:可完成文库在载片上的加载、样本序列信息的收集、序列信息的识别与初步分析。
Ÿ输入与输出:产品的输入为测序试剂、测序载片及测序文库;该产品的输出为FastQ文件与测序质量报告。
Ÿ用户体验:该产品具备开机自检、状态监测、自动报警、日志管理、用户权限管理、操作界面多语言、耗材识别、流程指导、测序自定义、数据安全、数据清理、云端数据传输、参数校准、具备常用通讯接口等有利于用户体验的功能。
1.5.技术
Ÿ准确性:可实现文库扩增PCR-Free。文库制备过程始终以原始单链DNA为模板进行等温扩增,单次扩增错误不会累积,最大程度还原基因组原始序列信息,避免指数扩增造成的错误积累。
Ÿ重复序列率:文库在测序中释放的荧光信号能够被准确的捕捉到,产出数据的Duplicate Rate平均低于5%,并提供证明。
Ÿ标签跳跃:Index Hopping的发生概率控制在0.0001%-0.0004%,并提供证明。
Ÿ测序技术优势:可提供原装基于抗体的测序试剂产品,以满足高准确率的测序需求。当进行PE100的读长时,测序错误率在0.5%以下。需提供证明材料。
Ÿ售后保障:厂家提供不少于5个山东驻地工程师,并提供厂家社保证明。
Ÿ其他支持:可提供不少于3个月的生信技术培训。
1.6.性能
Ÿ光学系统:能识别的间距≤715纳米、有四通道光路识别,采用四色荧光检测。
Ÿ测序载片需低温储存,可于常温使用,无需液态介质储存及使用。
Ÿ载片类型:有小载片和大载片两种通量规格可选,满足不同测序通量需求。小的单载片的有效Reads数不低于为300M,大的单载片有效Reads数不低于1500M。
Ÿ载片数量:配置双载片平台,支持单载片模式和双载片模式。
Ÿ加载系统:测序仪能满足自带或选配外置样本加载系统的功能,完成载片制备及样本加载。
Ÿ载片:具有密度大,避免荧光信号交叉影响的优势。
Ÿ测序应用:同时可独立运行≥8种测序应用。
Ÿ测序方式:该产品支持单端测序(SE)和双端测序(PE)。
Ÿ检测模式:可提供一键测序模式。
Ÿ读长支持:该产品支持读长类型为SE50、SE100、SE400、PE100、PE150、PE200。
Ÿ样本标签序列≥9个碱基(bp),可提高样本识别的精确度。
Ÿ可连续读取12个以上(如AAAAAAAAA)单个重复碱基序列信息。
Ÿ通量:该产品在PE150模式下单次运行可最高产生不低于1T的数据量。
Ÿ测序质量:读长≤200时,包括SE50、SE100、PE100,Q30>85%。
Ÿ信息分析:测序的同时能进行初步数据分析,并产生有质量打分的碱基序列。
2.数据分析模块
Ÿ无需分离培养,无需经验预判,对人原始样本中的微生物进行快速、准确、全面的鉴定。
Ÿ操作界面Web界面,按钮式操作,易用性强,无需掌握Linux命令和编程语言,上手快,门槛低。
Ÿ数据库除人源参考序列外,还内置了猪、山羊、绵羊、小鼠、大鼠、鲤鱼、家鹅、鸡、鸭、牛、猫、狗、兔等常见动物的参考序列,可实现自动过滤此类宿主信息,亦可根据客户需求定制。
Ÿ微生物鉴定:来源于RefSeq的基因组序列,包括细菌(包括古菌)、病毒、真菌和寄生虫,超过2.7万种种微生物基因组序列。
Ÿ分析流程数据质控——去除宿主——数据比对
Ÿ既可单独对RNA的宏转录组测序数据进行分析,也可单独对DNA的宏基因组测序数据进行分析,还能同时对样本的RNA宏转录组以及DNA宏基因组测序数据进行分析,能解决背景微生物的干扰,对样本进行更加准确的病原微生物鉴定,并找出活跃表达的致病性微生物。
Ÿ能对二代测序得到的Fastq数据进行一键式分析,并自动生成鉴定报告及分析结果。
Ÿ6小时内完成病原快速鉴定报告及鉴定结果文件。
Ÿ物种鉴定后得到的总的分类信息,并以交互式饼图的形式展示物种在DNA/RNA水平上的分类结果;提供DNA/RNA按照细菌、病毒、古生菌、真菌和寄生虫的鉴定表格和相对丰度信息;同时进行DNA和RNA分析的样本,还提供RNA vs DNA的物种活跃度结果。
Ÿ可对接实验室信息管理系统,可实现从样本制备到分析报告,端到端的全流程解决方案。
Ÿ服务器采用HP Z8 G4工作站,稳定可靠性强。
ŸCPU:2个Intel Xeon 6240 2.6 2933MHz 18核
Ÿ内存:192GB(12x16GB),硬盘:2.25TB固态硬盘;30TB机械硬盘
Ÿ显卡:NVIDIA Quadro P400 2GB(3)mDP GFX
Ÿ以太网连接:2 RJ-45集成千兆局域网
Ÿ键盘和鼠标:USB商务超薄有线键盘PRC和HP光纤有线USB鼠标
Ÿ可对细菌、真菌、病毒等病原微生物的测序数据进行组装、进化分析。
Ÿ数据质控、组装、基因预测、变异检测、毒力基因分析、耐药基因分析、基于核心基因进行进化树分析、基于全基因组SNP进行系统进化树分析等。
Ÿ既可进行有参组装也可以实现无参组装。
Ÿ可实现基因预测的功能。
Ÿ基于核心基因的进化树以及基于全基因组SNP的物种树分析
Ÿ可实现核心基因组分析的功能
Ÿ可实现变异检测的功能
Ÿ对细菌进行耐药基因分析的功能
Ÿ对细菌进行毒力基因分析的功能
Ÿ模块化程度高,对程序进行并行化运算,最大限度压缩信息分析周期。
五、供应商应具备的条件
1、满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定的供应商资格要求;
2、在中华人民共和国境内注册,具有有效的营业执照;
3、认同本文件。
六、响应文件内容
结合目前我市的疫情防控形势,各投标人要尽快制作好响应文件,并在报名期限内寄送至采购单位。所有资料必须真实有效,并加盖公章,否则不予计算分值或按照相关法律法规追究其责任,未加盖公章的视为无效报价,逾期视为放弃投标。响应文件要求如下:
1、封皮及目录;
2、企业营业执照、税务登记、企业代码证副本复印件(已三证合一的只需提供《营业执照》),加盖公章有效;
3、法定代表人身份证明复印件,加盖公章有效(格式详见附件);
4、法定代表人授权委托书(法定代表人签字并加盖公章后有效)及受托人身份证复印件加盖公章(格式详见附件);
5、提供设备的产品说明书,包括型号、参数、性能、等具体资料;
6、报价表、中标服务承诺书、服务优惠条款、同类产品的销售合同等资料;
7、项目实施方案、供货渠道、供货时间安排等;
8、根据评分表,供应商认为需要提交的其他资料。
七、报名时间
报名时间:2022年4月7日——2022年4月9日
报名邮箱:lcsjkzxbgs@lc.shandong.cn
邮寄地址:聊城市湖南路2号市疾病预防控制中心
八、评审方法
经确定最终采购需求和提交报价的供应商后,由评审小组采用综合评分法对提交报价的供应商的响应文件和报价进行综合评分(响应文件内报价为最终报价)。采购文件中没有规定的评审标准不得作为评审依据。评审时,评审小组各成员应当独立对每个有效的响应文件进行评价、打分,然后汇总每个供应商每项评分因素的得分。供应商的综合得分等于全体评审小组打分的算术平均值。
评审小组应当根据综合评分情况,按照评审得分由高到低顺序推荐成交候选供应商,并编写评审报告。评审得分相同的,按照最后报价得分由高到低的顺序推荐。
九、开标时间及方式
时间:2022年4月10日10:30
地点:聊城市疾病预防控制中心五楼会议室
联系人:窦先生
联系电话:0635-8535700
本次集中采购的最终解释权为聊城市疾病预防控制中心采购小组。
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