招标
NGS基因组数据分析加速软件采购需求
金额
-
项目地址
广东省
发布时间
2023/01/04
公告摘要
项目编号cbsysucc2023000005
预算金额-
招标联系人-
标书截止时间-
投标截止时间-
公告正文

中山大学附属肿瘤医院 - 竞价公告 (CBSYSUCC2023000005)
发布时间:2023-01-04 15:26:17 截止时间:2023-01-09 10:00:00
基本信息:
申购主题:NGS基因组数据分析加速软件
报价要求:国产含税
发票类型:增值税专用发票
付款方式:货到验收合格后付款
送货时间:发布竞价结果后7天内送达
安装要求:免费上门安装(含材料费)
预算:****** (元)

收货地址:广东省/广州市/番禺区/****
备注说明:
申购明细:
序号
1
采购内容
NGS基因组数据分析加速软件
数量
1套
预算单价
品牌
森特(Sentieon)
型号
v202112.05
规格参数
全模块,教育科研用途
技术参数:
1、基因组分析加速软件可支持Linux主流发行版,即Ubuntu和Centos。
2、基因组分析加速软件必须包含创建基因组索引功能。
3、基因组分析加速软件必须包含序列比对功能。
4、基因组分析加速软件必须包含三代长度长流程加速功能。
4、基因组分析加速软件必须包含变异查找功能。
5、基因组分析加速软件必须包含变异位点群体分析功能,参与万人以上人群项目不少于2个。
6、基因组分析加速软件利用CPU计算性能进行任务加速,不依赖GPU、FPGA等特殊硬件卡。
7. 基因组分析加速软件需支持ARM架构硬件平台。
7、基因组分析加速软件遵循行业标准BWA+GATK流程和Mutect2标准流程,各步骤可以拆分并且可以获得各步骤中间文件。
8、基因组分析加速软件与标准流程(BWA+GATK最佳实践流程, 简称Std)、Mutect2获得变异检测信息的一致性可以高达99%以上。
9、兼容MGI、Illumina、Pacbio等多个测序平台;
11、性能指标:
 胚系变异分析流程相比BWA-GATK开源流程提速5-10倍;
 胚系变异错检率叫GATK开源流程低2~3倍;
 体细胞变异分析流程相较开源BWA-Mutect2开源流程提速5-10倍;
 体细胞变异流程支持肿瘤-正常组织配对,纯肿瘤,肿瘤+正常基线等多种样本类型;
12、同时提供支持超算调度软件调用和容器调用2种使用方式。
质保及售后服务
按行业标准提供服务
附件
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