成都大熊猫繁育研究基地2024年测试服务采购项目公开招标更正公告（第一次）

招标

宏基因组建库测序测试服务

金额

项目地址

四川省

发布时间

2024/08/07

公告摘要

项目编号N5101012024001322

预算金额-

招标公司成都大熊猫繁育研究基地

招标联系人-028-61499830

招标代理机构成都一问工程技术咨询有限公司

代理联系人李女士028-83375882

标书截止时间-

投标截止时间-

公告正文

一、项目基本情况

原公告的采购项目编号：N5101012024001322

原公告的采购项目名称：2024年测试服务采购项目

首次公告日期：2024年07月24日

二、更正信息：

更正事项：采购文件和采购公告

更正原因：

采购文件技术参数变化

更正内容：

原公告的投标文件提交截止时间：2024-08-15 10:00:00，更正为：2024-08-26 10:00:00。

原公告的开标时间：2024-08-15 10:00:00，更正为：2024-08-26 10:00:00。

将原招标文件第三章3.3技术要求中第2条服务要求由

非靶向蛋白组（含高丰度蛋白检测）

1.仪器设备平台要求：供应商需要自行准备的仪器至少包括Agilent生物分析仪、PCR仪、Illumina Novaseq X Plus测序平台，DNBSEQ-T7测序平台，并能同步开展多组学项目。

2.技术要求：

1) DNA质量合格，总量满足要求。建议起始量：0.2μg；最低起始量：0.1μg；

2) 主带清晰。如DNA降解严重但是降解片段集中于1000bp以上（包括本数），经采购人同意可进行风险建库

3) 浓度：> 30 ng/μL

3.数据产出质量和数量要求：

1) 所有样本平均产出≥最终规格

2）数据质量Q20>90%，Q30>85％

3) N50≥1000

4.检测周期：

收到样品后不超过25个自然日

5.结果交付：

1）分析结果包含

1.1 数据质控统计表

1.2 有效数据统计

1.3 Alpha多样性分析，Beta多样性分析，物种注释与优势菌展示，物种差异分析

宏基因组建库测序

根据样品进行DNA提取，进行转录组测序和生物信息学分析，Q30 ≥80%。测序数据量（Clean data）：10G，分析内容：样本间基因表达水平的相关性分析、基因差异表达分析、差异表达基因的GO及KEGG富集分析、差异表达基因的蛋白质互作网络分析、差异表达基因中的转录因子鉴定等。包括个性化分析。

更正为：

30	非靶向蛋白组（含高丰度蛋白检测）	针对样本进行相对定量（常规+全扫描），常规非靶向定量分析使用液质联用（LC-MS/MS)技术，基于鸟枪法（shotgun）的数据采集方式。全扫描定量分析采用DIA（data-independent acquisition）技术(包括预实验评估和自建库)。质谱性能要求如下：仪器参数：全扫描MS：100fg 上柱量利血平的S/N为150：1、SIM：50 fg 上柱量利血平的S/N为150：1，分辨率为240,000 @ m/z 200，扫描速度为40 Hz；分析平台（常规）：用软件Mascot2.2和Proteome Discoverer1.4进行查库鉴定及定量分析；分析平台（全扫描）：Proteome Discoverer 2.2进行搜库，数据处理采用Spectronaut TM Pulsar；拥有质谱仪，具备自主蛋白提取，质谱测序等实验条件。
46	宏基因组建库测序	根据样品进行DNA提取，进行宏基因组测序和生物信息学分析，Q30 ≥80%。测序数据量（Clean data）：10G，分析内容：样本间基因表达水平的相关性分析、基因差异表达分析、差异表达基因的GO及KEGG富集分析、差异表达基因的蛋白质互作网络分析、差异表达基因中的转录因子鉴定等。包括个性化分析。