人血清microRNA高通量测序测序及信息分析

中标

金额

9.23万元

项目地址

广东省

发布时间

2021/09/17

公告摘要

项目编号jj21090710124545

预算金额9.9万元

招标公司广州体育学院

招标联系人安老师

中标公司合肥新唯基因科技有限公司9.23万元

中标联系人-

公告正文

人血清microRNA高通量测序测序及信息分析

发布时间：2021-09-17

人血清microRNA高通量测序测序及信息分析

竞价结果（JJ21090710124545）

开始时间：2021-09-07 10:12:00 截止时间：2021-09-14 10:12:00 截止时间已过

成交单位：合肥诺为尔基因科技服务有限公司

成交价： 92300.00元

说明：各有关当事人对竞价结果有质疑的，可以在竞价结果公告发布之日起3天内提起质疑，逾期将视为无质疑，不予受理。

采购单位：广州体育学院

联系人：安老师

联系电话：020-38025567

E-mail：[email protected]

传真：无

联系手机：无

邮编：无

质疑电话：02038027667

项目名称：人血清microRNA高通量测序测序及信...

竞价编号：JJ21090710124545

采购类型：服务类

开始时间：2021-09-07 10:12:00

项目预算（元）：99,000.00

结束时间：2021-09-14 10:12:00

采购单位：广州体育学院	联系人：安老师
E-mail：[email protected]	联系电话：020-38025567
传真：无	联系手机：无
邮编：无	平台联系电话（异议）：020-37619972、020-37636555
项目名称：人血清microRNA高通量测序测序及信息分析	竞价编号：JJ21090710124545
采购类型：服务类	开始时间：2021-09-07 10:12:00
项目预算（元）：99,000.00	结束时间：2021-09-14 10:12:00

项目名称：人血清microRNA高通量测序测序及信息分析

产品信息

序号	产品名称	产品类别	标配	单位	数量	应标品牌	应标型号	产地	偏离说明
1	人血清microRNA高通量测序测序及信息分析	专业技术服务	是	批	1.00	响应需求	响应需求	合肥	响应
规格配置：技术指标（参考品牌、型号）人血清microRNA高通量测序测序及信息分析乙方富集外泌体并提取外泌体RNA，基于Illumina 测序平台测序；平均每个样品产生10 M raw reads（单个样品数据量往下浮动小于5%），保证Q30达到85%，完成后期数据生信分析主要如下：（1）？测序碱基质量控制；（2）？测序数据产出统计；（3）？与参考序列进行比对，正链、负链比对数目统计；（4）？与相关生物数据库（miRBASE，RepBASE，Rfam，SILVA，GtRNAdb等）及参考基因组（或转录组）比对，分类注释Small RNA；（5）？已知miRNA鉴定与新miRNA预测；（6）？miRNA长度分布分析；（7）？small RNA基因组分布分析（针对有ref物种）及位置信息；（8）？miRNA碱基偏好性分析；（9）？miRNA碱基编辑分析；（10）？miRNA家族分析；（11）？miRNA定量分析；（12）？样本间相关性比较；（13）？miRNA差异表达分析：差异表达筛选；差异表达miRNA统计；（14）？差异表达miRNA聚类分析；（15）？miRNA靶基因预测；（16）？差异表达miRNA靶基因注释（NR、Swiss-prot、 Pfam、EggNOG、GO、KEGG）；差异miRNA靶基因GO、KEGG富集分析。技术指标（参考品牌、型号）人粪便16S多样性检测 "乙方对甲方提供的样品进行检测，选用引物为：细菌 16S rRNA 515F 5’- GTGCCAGCMGCCGCGG-3’ 907R 5’- CCGTCAATTCMTTTRAGTTT-3’，乙方完成PCR扩增后，使用Qubit3.0荧光计对每个PCR产物进行定量，从而进行均一化混合；使用Illumina Truseq DNA建库试剂盒对混合样品进行文库构建；Illumina平台测序，每个样品获得clean reads 3万条，完成后期数据生信分析主要如下：" 1. OTU聚类和物种注释（1）数据统计（2） OTU聚类（3）分类学分析 2. 样本多样性分析（α多样性分析）（1）稀释曲线（2） Shannon曲线（3） Rank Abundance曲线（4） Specaccum累积曲线（5）多样性指数 3. 物种组成分析（1） venn图（花瓣图）（2）组分图（默认门和属）（3） Heatmap图（默认门和属）（4）聚类树与组分图结合分析（5） core microbiome分析（6）优势物种组分图 4. 组间（样本间）比较分析（β多样性分析）（1） PCA （有无分组均可）（2） PCoA （默认bray curtis算法，有无分组均可）（3） Nmds （默认bray curtis算法，有无分组均可）（4）多样本相似度树状图（默认bray curtis算法）（5）组间距离分析（heatmap& 箱式图）（6） Adonis （需提供分组）（7） ANOSIM （需提供分组）（8）基于Unifrac PCoA 分析（有无分组均可）（9）基于UniFrac聚类树分析（有无分组均可）（10）基于Unifrac Nmds 分析（有无分组均可）（11）3D-PCA （12）3D-PCoA 5. 差异物种分析（1）差异物种LEFSE分析（需提供分组）（2）差异物种anova方差分析（3）差异物种Wilcoxon秩和检验分析（需提供两组分组，默认属） 6. 相关性分析（1） RDA/CCA分析（需提供环境因子）技术指标（参考品牌、型号）人粪便短链脂肪酸测序 GC-MS 检测短链脂肪酸（乙酸、丙酸、丁酸、异丁酸、戊酸和异戊酸）定量检测实验阶段 1. 样品处理； 2.GC-MS上机实验； 3. 导出色谱图、数据；数据分析阶段 "1.原始色谱图检查及可视化； " 2.定量各样品短链脂肪酸含量
售后服务：合同签署后20天内完成测试并提供合格有效的测试数据与结题报告。二、测试所需数据需真实有效，如果出现无效数据，中标供货商需要承担所有的后续补测所需费用及相关问题。

产品信息end