深圳大学 - 竞价公告 (CB105902023000843)
发布时间：2023-11-17 17:44:47 截止时间：2023-11-25 12:00:00
基本信息：
申购主题：大鼠高分辨率STOmics空间转录组测序
报价要求：国产含税
发票类型：增值税专用发票
付款方式：货到验收合格后付款
送货时间：合同签订后3天内送达
安装要求：免费上门安装（含材料费）
预算：191,000.00 人民币

收货地址：广东省/深圳市/南山区/****
供应商资质：
备注说明：
采购明细：

序号	采购内容	数量/单位	预算单价	品牌	型号	规格参数	质保及售后服务	附件

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大鼠高分辨率STOmics空间转录组测序

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技术服务

技术服务

一、技术服务内容： 完成6例大鼠组织高分辨率STOmics空间转录组测序及分析，具体包括： 1.样本组织冷冻切片染色； 2.样品组织样本优化（每个组织需单独做透化时间优化实验）； 3.高分辨率STOmics空间转录组测序，每份样本产生 1G pair-end reads； 4.完成相应的信息分析。 二、技术路线： 对采购方提供的6个组织样品进行检测，样品检测合格后采取以下技术路线进行高分辨空间转录组测序： STOmics®高分辨空间转录组样品制备――上机测序――生物信息学分析。 三、分析内容： 1.测序数据统计与评估：数据比对与基因表达定量、图像配准、bin分析以及最优bin策略选择、低质量bin过滤以及最终bin表达量矩阵生成； 2. bin聚类分析：bin聚类结果统计、各样本在各亚群bin数量统计、基因在各个bin亚群表达量均值统计、分群结果可视化； 3.亚群上调基因分析：上调表达基因筛选、上调表达基因GO功能富集分析、上调表达基因KEGG功能富集分析、上调表达基因Reactome功能富集分析（仅限大鼠） 4.亚群特征基因分析：亚群特征基因筛选、亚群特征基因表达分布、亚群特征基因蛋白质互作网络分析； 5.空间差异基因分析：空间差异基因筛选、空间差异基因GO功能富集分析、空间差异基因KEGG功能富集分析、、空间差异基因Reactome功能富集分析（仅限大鼠） 6.空间特征基因分析：空间特征基因筛选、空间特征基因表达分布、空间特征基因蛋白质互作网络分析。 四、知识产权:项目阶段性成果及最终科研成果的所有权归属于采购方。

按行业标准提供服务