中标
植物组织样本上机测序服务
金额
-
项目地址
广东省
发布时间
2019/11/06
公告摘要
项目编号-
预算金额7.99万元
招标公司-
招标联系人-
中标公司-
中标联系人-
公告正文
CF105902019001600
2019-10-23 18:02:35
2019-11-05 00:00:00
人民币
免费上门安装(含材料费)
文库构建服务
79900.00
晶能生物技术(上海)有限公司
1. 技术目标:利用文库构建试剂盒构建smallRNA文库,mRNA文库,lncRNA文库,符合Illumina Hiseq3000 V4试剂测序平台、illuminaX-ten测序平台或者illumina navo-seq测序平台的文库的单上机测序要求,测序模式为150PE,每个数据质量Q30>90%。 2.技术内容:基本数据质控。 3.技术方法和路线: 3.1文库质检流程:针对甲方构建好的文库,乙方采用ABI公司的stepONE plus QPCR仪进行文库质检,当文库检测为单峰,且浓度高于3nM,体积大于25ul则判定为合格。 3.2 Cluster制备:按照Illumina标准Cluster生成,pooling和定量方法进行样本文库混合,并制备Cluster。 3.3数据质控标准: 1)去除含有adaptor的reads; 2)去除N的比例大于10%的reads ; 3)去除低质量reads(质量值Q <= 3的碱基数占整个read的50%以上)的reads。 4 周期 4.1. 收到文库及信息单的次日起计算,在3个工作日内完成文库质检,并提供相应的质检报告;当一次性寄送文库数量大于50个样本,检测时间将顺延3个工作日。 4.2.在完成文库QC后的15个工作日内完成测序及数据产出,并利用技术路线中的质控标准进行数据质控。 4.3.生信分析 测序数据质量统计 ;参考基因组比对;基因表达定量;差异基因筛选;差异表达基因GO功能分析;差异表达基因GO功能富集度分析;差异表达基因KEGG功能富集分析;差异表达基因蛋白质互作网络分析;差异表达基因转录因子分类,并根据客户要求进行个性化分析。 5.公司需为AAA级信用企业,高新技术企业,具有研发公共服务平台,需具备illumina nova—seq平台,Illumina Hiseq3000 V4试剂测序平台具有9年以上的测序服务经验。 完成100个样的文库构建,基因测序及数据分析服务
1.0
按行业标准提供服务;测序服务达到以下要求:1,文库合乎上机要求;2,数据产出:Q30>83%(Hiseq 2500 125PE); Q30>90%(Hiseq 2500 50SE);Q30>85%(Illumina X-ten;illumina navo-seq;Hiseq 3000)。(未达到要求的,重新补测)
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