中山大学眼科学国家重点实验室多维图像分析系统采购项目
基本信息

项目编号	中大招（货）[2023]188号
项目名称	中山大学眼科学国家重点实验室多维图像分析系统采购项目
项目类型	货物采购	申购主题	多维图像分析系统	采购单位	中山大学
项目预算	***	采购开始时间	2023-09-21 08:14	采购结束时间	2023-09-28 09:00	是否送货	是
期望收货时间	合同签订后10天交货	经办人	赵老师	经办人电话	020-84115087
送货地址	广东省广州市天河区珠江新城金穗路7号中山大学中山眼科中心
电子签章	本项目需要使用CA签字 CA操作手册下载
备注	1、国内供货请报含税人民币价；境外供货（进口）请报免税人民币价或外币价，报免税人民币价的公司必须有境外人民币收款账户。 2、进口货物中如有国内供货部分，供应商在报价时应分别报价，境外供货部分、国内供货部分的币种选择见第1条，并分别签订进口货物采购合同和国内采购合同。 3、本项目学校不收取任何费用， 外贸代理费由供应商支付。4、本项目需要使用CA证书，请供应商根据指引（http://bidding.sysu.edu.cn/article/4902）提前办理CA证书。 5、技术参数中如标注有“★”号的条款必须实质性响应，负偏离（不满足要求）将导致报价无效。

设备列表

采购设备	数量	参考品牌	详细响应要求
多维图像分析系统	1台	【Imaris】 【Hugens】 【Arivis】	详情请进入系统查看
"多维图像分析系统"技术要求
序号 技术要求内容 评分等级 是否需要附件说明 1 多维图像可视化分析软件，能够应用于生命科学研究领域 3D/4D/ 多维图像展示、渲染及交互分析，可对宽场、激光共聚焦、转盘共聚焦、全景共聚焦、多光子、光片扫描显微镜、超分辨荧光显微镜及电镜等大部分显微镜厂商的成像数据进行定量和定位分析。 重要 否 2 一.多维图像渲染： 1. 实验数据的编辑，检索及管理系统，可对多维数据进行 Normalize /Background Subtraction等前处理。 重要 否 3 2. 涵盖MIP, Blend, Normal Shading, Shadow Projection等五种不同应用需求的多维图像渲染模式，并可对原始结果进行剪切等展示操作。 重要 否 4 3. 自带影像编辑功能，可自由创建电影，可添加 Slicer/Clipping plane等多种展示模式记录展示效果，可输出图片或视频格式。 重要 否 5 4. 支持TB (Terabyte)级别的数据渲染与展示。 重要 否 6 二.多维空间测量Measurement Pro： 1. 可自动计算包括荧光强度，角度，大小，形状，位置在内的多种数据。 重要 否 7 2. 可通过手动描绘任意感兴趣的区域并进行渲染和计算，从复杂大数据中创建Surface和Spot对象，交互式渲染大量的Surface对象和数以百万的Spot对象，使用机器学习分类或交互式筛选工具对Spot 和Surface对象进行分类、标记。 重要 否 8 3. 可通过提供的各种数据，对实验结果进行分类、排序或筛选，支持TB (Terabyte)级别的数据分析，并可导出所有的数据。 重要 否 9 4. 在每个通道的基础上测量强度，可根据荧光强度的分布，测算任意结构的空间距离及角度信息。 重要 否 10 5. 可根据识别到的类別来展示和比较参数，根据任意计算参数对检测对象进行颜色编码，直观地选择对象提取关键参数。 重要 否 11 6. 利用二维Contour轮廓线功能进行半自动构建和测量三维物体，与随机分布相比的对象间的吸引和排斥测量，计算对象之间的距离与重叠区域。 重要 否 12 三.交互式编程接口： 1. 可通过多种编程语言例如Matlab, Java, Python对Imaris的图像处理。 重要 否 13 2. 可编写新的算法，并添加至软件中；在软件中整合了Fiji/ImageJ插件。 重要 否 14 ▲3.整合了近七十种自定义程序，提供更加简便和全面的数据分析和处理插件。 非常重要 否 15 4.由 Labkit 提供支持的机器学习像素分类。 重要 否 16 四.细胞谱系分析： 1. 可对多个对象同时跟踪，显示可视化运动轨迹，轨迹可以与任何3D渲染目标结合在一起，形成多维可视化图像。 重要 否 17 2. 自动或手动获得多种轨迹追踪的实验数据，包括持续时间、移动距离、速度、加速度等，可显示与时间相关的大小，荧光强度等各种参数变化情况，还可根据提供的所有参数，进行分类，排序和筛选，并导出所有的数据。 重要 否 18 ▲3. 针对布朗运动，自回归运动，连贯运动等不同运动方式，提供多种轨迹追踪算法。 非常重要 否 19 4.提供Brownian Motion/ Autoregressive Motion /Connected Components/Lineage等6种算法，用于各类数据的自动轨迹追踪和分析。 重要 否 20 5. 交互式编辑、创建和修改轨迹和追踪对象。 重要 否 21 6. 自动检测细胞分裂事件，以确定细胞周期的持续时问和生成，同时显示交互式谱系树。 重要 否 22 7. 自定义坐标系，校准时间序列成像过程中样本位移，旋转等，并能得到校准后的所有数据结果。 重要 否 23 8. 针对发育及细胞谱系研究提供新算法，可自动获得细胞分裂相关数据，展示和标记分裂的动态过程。 重要 否 24 五.神经数据(分支状结构)分析： 1. 可渲染和展示明场或荧光采集的神经结构，以及与神经结构类似的分支状结构，如血管，细胞骨架，植物气孔等。 重要 否 25 ▲2.可得到长度，直径，角度，分支节点数，分支结构（如树突，树突棘）的数量，密度等，并根据提供的所有参数，进行分类，排序和筛选，以及导出所有的数据 非常重要 否 26 ★3. 提供手动、半自动和全自动等多种计算方式，辅助超大数据的渲染和计算。 非常重要 是 27 4. AI驱动的区块化算法，可实现更快的渲染速度与网络追踪。 重要 否 28 5. 可自动或半自动追踪检测并分析丝状结构，得到长度，直径，分支节点，密度等统计数据。 重要 否 29 6.针对神经生物研究，可提供超过200种统计数据，用于不同应用的结果分析。 重要 否 30 7.全自动树突棘检测及形态学特征分析。 重要 否 31 8.针对全结构、每一分枝、片段及特征点的交互式编辑。 重要 否 32 9.神经元胞体、树突棘及其它非丝状结构的展示选项（如大小，颜色）。 重要 否 33 10.检测并追踪形状、位置随时间的变化。 重要 否 34 11.结合轨迹追踪，可得到分支状结构的生长速度，生长密度等数据。 重要 否 35 六．共定位分析： 1.支持2D、3D、4D多维的共定位分析，可输出共定位结果并得到 Pearson`s coefficient， Mander`s coefficient 等国际通用的共定位参数（可获得统计参数≥10）。 重要 否 36 2.提供两种共定位算法，用于弥散或边界清晰的荧光信号分析。 重要 否 37 3.提供多种共定位阈值选择方法，包括基于已有算法的自动模式。 重要 否 38 4.实时获取统计数据。 重要 否 39 5.以新的3D/4D通道显示数据。 重要 否 40 6.扩展或缩小直方图中的计算范围。 重要 否 41 7.支持对选区（Region of Interest, ROI）进行共定位分析。 重要 否 42 8.用较少的步骤分析整个时间序列的共定位。 重要 否 43 七．GPU加速的ClearView^TM反卷积 9.包含 Spinning Disk Confocal, Widefield Fluorescence, Brightfield, Laser Scanning Confocal 以及 TIRF 等多种算法（支持4种算法）。 重要 否 44 10.支持 NVidia 和 AMD 的GPU 加速和优化。 重要 否 45 11.同时支持 Mac 和 Windows 系统 重要 否 46 八．多维图像拼接Stitcher： 1.支持TB级别的大数据拼接 重要 否 47 2.支持二维、三维、四维多通道图像的拼接。 重要 否 48 3.支持自动或手动拼接。 重要 否 49 九、工作站一套，附件参数： 1. 处理器：2个intel Xeon Platinum (铂金) 8260/55C系列24核心,2.5Ghz,共48核心，96线程， Intel True Scale Fabric Technical Engineer 认证工程师证书。 重要 是 50 2. 内存：10条64G DDR4 RECC 2933MHZ，共640GB; 硬盘：1*960G SSD 企业级，ISO27001认证证书;存储：3块16T SATA企业级,2块4T SATA企业级，共56TB;显卡：NVIDIA GTX 3080 10G; 显示器：27寸 4K高清显示器;电源：1000W高效服务器电源。 重要 否 51 ▲3.正版集群任务调度系统。包括数据分析系统整机测试报告样本，a.提供高斯采用m06、b3lyp、ccsd、mp2等方法验证算例的优化截图；b.提供基于3D-药效团模型进行精确虚拟筛选的集成平台，不低于640核心运行载图，多任务交互作业证明文件；c.提供Materials Studio运行200核心以上的优化证明数据。 非常重要 是 52 ▲4.提供国家认证的高级工程师证书,以确保工作站软件正常培训使用、故障维护和系统升级。 非常重要 是 53 ▲5.提供软件服务R,WBA,R、Bwa、Perl、Biopython、Python、Blast、Fasta、Hmmer、Clustalw、DNAStar、Paml、Emboss 、TotalView、ParaWise、AVS、Autodock、Zdock、3D-dock、Rosetta、Phred，CUDA CUDNN，caffe，torch，tensorflow，提供电子结构计算和量子力学-分子动力学模拟软件包（vasp）优化证明数据。 非常重要 否 54 ▲6.产品通过国家3C认证，中国节能产品认证，中国环境标志产品。 非常重要 是 55 软件及其功能：是具有国外专利的成品软件; 重要 否 56 培训要求： 1.在软件安装调试结束后，负责对用户的操作人员进行系统的现场培训，包括操作流程，日常维护和简单故障排除等。 2.提供每年的系统的使用培训，并在之后帮助解决复杂的技术问题。保证每季度至少一次上门回访、检修。 重要 否

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