项目名称	geochip测试服务	项目编号	FJNU-JJ-230055
公告开始日期	2023-07-25 05:31:29	公告截止日期	2023-07-28 07:00:00
采购单位	福建师范大学	付款方式	服务完成、验收合格付清全款
联系人	中标后在我参与的项目中查看	联系电话	中标后在我参与的项目中查看
签约时间要求	成交后5日内	到货时间要求	签约后90个工作日内
预算总价	￥ 439600.00 + NaN + NaN
发票要求	增值税普通发票 增值税专用发票
含税要求
送货要求
安装要求
收货地址	福建师范大学地理科学学院
供应商资质要求	符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件
公告说明

采购清单1

采购商品	采购数量	计量单位	所属分类
geochip测试服务	80	个	其他自然科学研究和试验开发服务 无 无

品牌 品牌1
型号
品牌2
型号
品牌3
型号
预算单价	￥ 5495.00
技术参数及配置要求	1. 森林土壤样品 GeoChip检测： 1.1 完成80个土壤样本的DNA提取。DNA样本质检结果要求：无 RNA、蛋白质等杂质污染，OD260/280：1.8-2.0，D260/230:1.5-1.8；DNA浓度≥50ng/ul，总量≥4ug。如个别样本不能满足后续实验需求，免费重新抽提质检； 1.2 基于荧光标记和芯片杂交的GeoChip技术，检测80个土壤样本的GeoChip 60K功能基因的信号和丰度信息。 GeoChip 60K检测数据质量要求： 1.2.1 必须使用 Multi-TIFF模式对芯片进行扫描，生成图片格式数据； 1.2.2 必须使用Agilent Feature Extraction 软件将探针的光学信号转换为数字信号； 1.2.3 必须使各个样本光强总和调整到同一批次光强最高的样本的水平； 1.2.4 每个点周围的空白点的信号强度用于计算信噪比，移除信噪比小于 2.0 的信号点； 2. 森林土壤样本的GeoChip数据分析： 2.1 功能基因组成分析 基于raw_data分别统计各样品在功能大类、功能亚类和基因层级的探针检出数及信号强度，同时绘制柱状图和热图，并基于raw_data中探针的有无进行样品间/组间共有特有探针数统计以及 venn 图的绘制。 2.2 Alpha 多样性分析 基于normalized_data进行Alpha多样性指数计算，了解各样品探针的多样性，同时以柱状图的形式进行展示。 2.3 Beta多样性分析 基于normalized_data进行Beta多样性指数计算，得到样品间距离矩阵，了解样品间探针 构成的差异性和相似性，并结合样本距离heatmap图进行直观展示。 2.4 降维分析 基于normalized_data或Beta多样性指数的距离矩阵进行PCA、PCoA和DCA等降维分析，以便直观展示样本间的差异性和相似性。 2.5 组间差异分析 基于normalized_data分析组间功能结构的差异是否显著，默认选择常见的Anosim和Adonis等组间群落差异显著性检验方法.基于norm_gene_intensity、norm_sub_cat_intensity、 norm_gene_cat_intensity分析gene、sub_cat及gene_cat层级对应的探针信号强度在组间的差异大小，挖掘组间有显著差异的基因或功能类别。 2.6 相关性分析 基于normalized data进行基因和环境参数的基础相关性分析，并以heatmap图进行展示，并进一步进行CCA/RDA分析，BioEnv分析，VPA分析，曼特尔检验等。 3. 交付周期 3.1 成交人收到所需样品和样品信息单，且样本核酸质检合格正式开始计算项目服务周期； 3.2 成交人在样本入库完毕后的6个自然日内完成样本核酸提取和核酸质检，并发送核酸质检报告； 3.3 样本质检合格并得到用户的确认后，在90个自然日内完成GeoChip检测与分析工作； 4. 售后服务 4.1 售后咨询：项目交付12个月内，供应方免费提供项目咨询服务； 4.2 项目结题：成交人以邮件形式所提供的结题报告后2个工作日内回复邮件进行确认，逾期未确认的，默认为项目结题； 4.3 个性化分析：用户在个性化分析启动前一次性以书面方式列出所有分析需求，由成交人后台人员评估后给出分析方案、费用及周期。 5. 其它要求： 5.1 所获得的数据成果所有权归采购人所有； 5.2 成交人需与采购人充分沟通样品制备、保存及运输方式以使项目顺利进行。 5.3 成交人获得GeoChip产品厂家Glomics Inc.的代理授权证明，并在签订合同时提供原件及加盖成交方公章的复印件。
参考链接
售后服务	服务年限:质保期一年;

2023-07-25 05:31:29
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