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招标公司南京警察学院
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南京警察学院 - 竞价公告 (CF122132023000251)
发布时间:2023-12-13 16:42:47 截止时间:2023-12-16 16:52:34
基本信息:
申购主题:广泛靶向代谢组测序+转录组测序
报价要求:国产含税
发票类型:增值税普通发票
付款方式:货到验收合格后付款
送货时间:合同签订后7天内送达
安装要求:免费上门安装(含材料费)
预算:****** 人民币

收货地址:江苏省/南京市/雨花台区/****
供应商资质:
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采购明细:
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采购内容
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规格参数
质保及售后服务
附件

1
广泛靶向代谢组测序+转录组测序
40



一、完成40例动物样本,有参转录组测序,并完成相应的生物信息分析
1.测序数据质控基于raw data:
①去除接头序列及低质量reads pairs;
②测序数据统计;
③ 统计错误率、质量值、GC含量;
2.比对分析基于提供的参考基因组序列信息:
① 比对结果统计;
②比对区域分布分析;
③Reads密度分布分析;
3.基因结构分析① 新转录本分析;
②可变剪接分析;
③SNP / InDel 分析;
4.基因水平分析① 基因表达水平定量分析;
②样本间相关性分析(≥ 2个样品);
③ 基因差异表达分析(≥ 2个样品)
5.差异基因功能分析① 样本间差异基因的GO富集分析(≥2个样品);
②样本间差异基因的KEGG富集分析(≥ 2个样品);
6.蛋白互作网络分析 样品间差异表达基因的PPI分析(≥2个样品)。
7.需要蛋白-蛋白相互作用数据库中有该物种的注释信息;
二、完成40例动物样本,广泛靶向代谢组学测序,并完成相应的生物信息分析
2、基本分析 1).测序结果统计; 2).代谢物注释; 3).定量分析 ;标准分析 4). 主成分分析; 5).样本间差异代谢物聚类分析;6).差异代谢物的代谢通路分析;7).差异代谢物富集的KEGG通路图;8).差异代谢物的ROC曲线;3、结合结果进行个性化需求分析。
按行业标准提供服务


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