根据业务需要，成都华西精准医学产业技术研究院有限公司按照公开、公平、公正原则，通过比选方式，择优选择一家服务商，提供肺组织蛋白质组学及代谢组学检测项目服务。现将有关事项公告如下：
一、基本情况
成都华西精准医学产业技术研究院有限公司（以下简称“公司”）于2017年5月27日在成都市天府新区正式注册成立。公司由四川大学华西医院牵头建设，华西医院指定四川华西健康科技有限公司,成都市政府指定成都科技服务集团有限公司，两方共同出资成立。
二、项目概况
2.1项目名称：成都华西精准医学产业技术研究院有限公司采购肺组织蛋白质组学及代谢组学检测项目服务。
2.2 项目要求
| 序号 |
物资 名称 |
工作内容、检测项及质量标准 |
| 1 |
肺癌组织蛋白组检测分析 |
一．概况 对肺组织样本（包括癌组织和癌旁组织）进行DIA或4D-DIA蛋白质组学检测。
二．平台 1） 质谱平台：Bruker tims-TOF Pro或Q-exacitve HF-X（Thermo）等； 2） 分析平台：搜库和数据处理采用SpectronautTM Pulsar，； 3） 质谱检测精度：内标<1 ppm RMS；外标<3 ppm RMS； 4） 仪器分辨率≥240000（200m/z）；扫描速度40Hz； 5） 数据库搜索质控：Peptide FDR ≤0.01及Protein FDR ≤0.01； 6） 承诺指标：单个样本蛋白检测数量≥6000个蛋白。
三．质控要求 1） 实验前对样本进行蛋白质组分析和测试（包括预实验评估和自建库）； 2） 对所有的样本蛋白进行BCA定量和样本蛋白完整性的质控实验； 3） 正式进样前混样QC-mix至少连续重复进样3次，对混样QC-mix的TIC图进行重叠，根据重叠情况判断仪器是否稳定； 4） 每20个样本插入一个QC-mix进行检测，比较各次QC-mix检测结果，保证所有样品检测过程中的仪器稳定； 5） 每个样品检测后加一个Blank用于清洗和监控残留污染。
四．分析内容 基本分析+高级分析+个性化分析+多组学关联分析；蛋白组分析包含但不限于肽段检测列表、蛋白检测列表、PCA主成分分析、组间差异的聚类分析、火山图分析、GO分析、KEGG pathway分析、PPI分析、COG分析、NMF分子分型、GSEA富集分析和组学关联分析等。
五．服务能力 如果参选单位提供4D-DIA技术，需满足以下参数： 1） 参选单位拥有Bruker tims-TOF Pro质谱仪； 2） 具备自主蛋白提取，质谱鉴定等实验条件； 3） 拥有独立的研发与分析团队，具备提供详细鉴定方案以及提供个性化分析的能力； 4） 参选单位主要技术人员以第一作者或者通讯作者在蛋白组学或者蛋白修饰杂志发表过单篇影响因子在10分以上文章； 5） 参选单位拥有2年以上Bruker tims-TOF Pro平台设备运行质谱检测经验，提供2年以上的Bruker tims-TOF Pro质谱仪检测样本合同明细、RAW文件等证明； 6） 参选单位具有蛋白质组功能注释自动化软件、蛋白组学数据分析自动化软件等，并提供相关证书； 7） 项目验收之后，能提供持续1年的免费售后分析、持续性数据解析，服务内容包括数据的解读、解析、数据的深入挖掘与利用、文章方案设计、文章组图设计参考、文章投稿意见、文章撰写建议等。
六．结果交付： 1） 原始数据+结题报告+结果文件，40个工作日内交付所有结果（含数据分析）； 2） 数据交付需提供完整的实验报告，具体包括： a） 蛋白质质检报告：所有检测样本的浓度和电泳图； b） 实验文件：实验操作流程、常用软件、技术文档、注释文件； c） DIA质控报告：提供样本质检报告、DDA建库结果信息、数据质控结果，数据校正等质控信息； d） 实验数据报告：原始数据、数据质控、生信分析等； 3） 多余组织样本和提取物需返回给比选方； 4） 承诺：不瞒报、谎报、漏报检测数据、结果等信息；承担保密义务，不得泄露、擅自使用或对外发布检测结果和相关信息，严格遵守国家法律、法规和有关纪律要求。
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| 2 |
代谢组 |
一．概况 对肺组织样本（包括癌组织和癌旁组织）进行代谢组学检测服务。
二．平台及质控要求 1） 质谱仪：超高效液相色谱+高分辨质谱仪（triple TOF或QE系列等）； 2） 项目进行前额外使用混合QC以平衡色谱体系； 3） 每10个样本插入混合QC； 4） 每20个样本插入BK样本检测残留； 5） 报告需要提供空白BK样本证明数据残留情况； 6） 常规PCA质控外，还需要使用多内标RSD监控仪器稳定性； 7） 单个样本准确有效检出率代谢物1000以上。
三． 分析内容 1） 代谢小分子的定性和定量检测 2） 数据质控，总离子流图 3） 数据标准化和归一化 4） 主成分分析 5） 正交偏最小二乘-判别分析 6） 差异代谢物筛选 7） 差异代谢物聚类分析 8） 差异代谢物相关性分析 9） 差异代谢物的火山图展示 10） 差异代谢物对样本的聚类热图 11） 差异代谢物的通路富集分析 12） 组学关联分析
四．结果交付 1） 结果交付：原始数据+结题报告+结果文件，40个工作日内交付所有结果（含数据分析）； 2） 数据交付要求： a） 样本实验报告：实验操作流程、仪器试剂、色谱质谱参数； b） 实验文件：LC-MS物质鉴定表格、差异代谢物分析表、总离子流色谱图（TIC）、生信分析图表； c） 质控报告：提供样本质检报告、数据质控结果，批次校正等质控信息； d） 生信分析报告：PCA分析、差异代谢物筛选和火山图、差异代谢物层次聚类分析、差异代谢物Z-score图、代谢物KEGG注释、差异代谢物相关性分析等； 3） 多余组织样本和提取物需返回给比选方； 4） 承诺：不瞒报、谎报、漏报检测数据、结果等信息；承担保密义务，不得泄露、擅自使用或对外发布检测结果和相关信息，严格遵守国家法律、法规和有关纪律要求。
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2.3 最高限价：45万元（含税）
2.4 资金来源：成都市财政经费。
三、比选申请人资格要求
参与本次比选系统服务商需符合以下条件：
（一）在中华人民共和国境内注册，遵守国家相关的法律法规政策，信誉良好，近三年无重大事故和不良行为记录；
（二）具有独立法人资格，具有企业法人营业执照、组织机构代码证和税务登记证（三证合一的提供营业执照）；
（三）具备售后服务和技术支持团队。
四、比选办法
本项目按照国家政府采购相关政策，采用“综合评分法”，由比选委员会对通过资格审查的比选申请人，按照评分由高到低的顺序，确定1—3名中选候选人。
五、比选材料领取截止时间及地点
凡有意且满足申请人资格要求的，请于2021年9月18日至2021年9月26日（上午8时30分至12时00分，下午14时00分至17时30分），通过以下方式领取比选文件。
电子邮件发送。请将单位介绍信、身份证复印件、及企业营业执照副本复印件加盖公司鲜章后扫描发送至邮箱hxjzcyyhr@163.com，通过我司审核的单位，我司将于3个工作日内予以回复。
注意：请务必按比选文件要求准备并提交参选材料，逾期未领取比选材料或未提交参选材料的，视为无参与比选意向或放弃参选。本次比选不收取任何费用，参选机构准备比选文件、出席比选会的交通费等费用由参选机构自理。
六、 发布公告的媒介
四川大学华西医院（http://www.wchscu.cn/）
成都华西精准医学产业技术研究院有限公司（http://www.hxjzyx.com/）
作者：设备物资部 编辑：设备物资部 来源：设备物资部
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