（中国医科大学附属第一医院纳米孔三代测序系统（国家医学检验临床医学研究中心）采购项目）招标公告
项目概况
中国医科大学附属第一医院纳米孔三代测序系统（国家医学检验临床医学研究中心）采购项目招标项目的潜在供应商应在线上获取招标文件,并于2022年12月23日 15时00分（北京时间）前递交投标文件。
一、项目基本情况
项目编号：JH22-210000-64380
项目名称：中国医科大学附属第一医院纳米孔三代测序系统（国家医学检验临床医学研究中心）采购项目
包组编号：001
预算金额（元）：3,000,000.00
最高限价（元）：3,000,000
采购需求：查看
品目1：纳米孔三代测序系统 1套 进口
一、主要技术参数
1.主要功能：利用纳米孔测序技术，根据电流信号变化实现对DNA和RNA分子的高通量单分子实时测序。适合各种样本，包括人类基因组、动植物基因组、微生物基因组DNA和RNA测序。集成高性能数据处理可减少对复杂IT基础设施的需要。长读长可提高对重复区域、结构变异、定相等分析。
2.测序原理：利用纳米孔电流信号变化识别碱基序列。
3.可便携：设备具备可移动性，且性能稳定，不受外界环境条件制约，可进行户外操作。
4.易维护：无复杂的激光或光路系统，安装简便易用，插电即可使用。
5.计算能力：集成一台高性能计算机，可用于数据获取，存储以及碱基转换。
6.通量：可同时运行1-5张独立的芯片，每张芯片单独控制，在其他芯片运行时可增加运行更多的测序芯片，支持DNA测序和RNA测序同时运行。
★7.读长：单条序列最长读长>150,000 bp。
8.允许对整个4 Mb的主要组织相容性复合体区域进行定相分析。
9.测序准确度：单分子测序≥95%。30×覆盖度≥99.9%。
10.数据总产量：25-150 Gb（所有5张芯片同时进行测序）。
11.检测能力：具备8小时内完成致病微生物全基因组组装、分析和溯源能力。
12.测序一小时内，可准确鉴定到PML-RARA白血病的基因融合。
13.纳米孔检测通道：512-2560个测序通道。
14.平均测序速度：250-400 bp/s。
15.实时测序，获取第一条序列的时间为运行后2分钟。
16.运行时间：1 min-72 h，可以根据实验需求设置。
17.测序中途可终止运行，芯片可清洗反复使用。直接存储原始fast5格式测序数据。
18.建库简单方便，可实现在10分钟之内完成文库的制备，可提供混样建库选项。
19.混样建库能力：每张芯片可混样建库96个样本。
★20.可实现DNA分子直接测序，无需PCR扩增，免除PCR扩增带来的错误。
21.可实现RNA分子直接测序，无需反转录成cDNA。可消除通过扩增或反转录引入的潜在偏向性，而且可在测序同时检测碱基修饰。
22.在识别核苷酸序列的同时识别表观遗传修饰，如5mA，m6C等。
23.可对转录本异构体和融合转录本进行准确的定量和识别。
24.系统预先安装测序数据分析的常用工具，包括碱基读取、数据质量控制、barcode拆分、序列比对、基因组组装、宏基因组分析、扩增子分析、测序错误校正、变异分析、碱基修饰等。
25.配套广谱病原微生物及耐药分析系统：
25.1可支持主流二代和三代测序下机数据的分析，包括fastq，fast5以及对应压缩包格式。
25.2可支持单样本和多样本测序数据自定义导入分析，提供样本名称编辑功能。
25.3提供从下机数据到生信结果一键式分析，无需分步操作。
25.4支持16s rDNA扩增子和宏基因组测序数据分析。
25.5可同时检测≥40000种物种信息条目，包括病毒、细菌、真菌、原虫、古菌等。
25.6提供物种分类、NCBI物种号、相对丰度和致病性信息，以及所有物种序列下载功能。
25.7提供耐药元件鉴定、耐药机理和耐药药物鉴定等分析，以及毒力元件鉴定和毒力机理等分析。
25.8微生物物种分类结果展示界面，支持根据序列数量对展示结果进行动态筛选和展示。
25.9支持主流组装软件选择，提供无参、有参和混合组装三种组装模式，组装结果可在软件界面直接查阅以及自定义保存。
25.10基于有参组装模式，提供全基因组突变位点分析，包含突变位点位置、碱基变化、位点测序深度和杂合情况信息。
25.11提供样本全基因组覆盖度图，获知基因组不同区域测序深度。
25.12提供基因组组装序列注释结果、耐药和毒力分析以及至少100种细菌MLST分析。
25.13溯源分析支持多样本和不同格式数据输入，提供基因组相似度图表、聚类热图、系统发育树、最小生成树、差异位点信息比较表、样本信息统计等。
25.14提供结果数据做图、统计功能以及图表输出功能。
25.15提供样本管理系统，支持输入样本的具体信息，包括样本病案信息、取样信息、临床诊断信息，支持样本信息和数据分析管理关联等。
25.16支持一键输出可打印的分析报告，支持图形和表格等结果的下载和输出。
25.17分析系统能够提供国家认可的计算机软件著作权登记证书或其他知识产权证明。
26.配套组装分析软件系统：
26.1支持主流二代和三代测序下机数据的分析，包括fastq，fast5以及对应压缩包格式。
26.2支持单样本和多样本测序数据自定义导入分析，提供样本名称编辑功能。
26.3提供从下机数据到生信结果一键式分析，无需分步操作。
26.4支持主流组装软件选择，提供无参、有参和混合组装三种组装模式，组装结果可在软件界面直接查阅以及自定义保存。
26.5基于有参组装模式，提供全基因组突变位点分析，包含突变位点位置、碱基变化、位点测序深度和杂合情况信息。
26.6提供样本全基因组覆盖度图，获知基因组不同区域测序深度。
26.7支持基因组组装序列注释，包含基因类型、基因名、基因位置、EC号、COG号和功能描述，提供gff，gbk等注释文件。
26.8提供结果数据做图、统计功能以及图表输出功能。
26.9提供样本管理系统，支持输入样本的具体信息，包括样本病案信息、取样信息、临床诊断信息，支持样本信息和数据分析管理关联等。
26.10支持一键输出可打印的分析报告，支持图形和表格等结果的下载和输出。
★二、配置
1.纳米孔测序系统主机1台。
2.广谱病原微生物及耐药分析软件1套。
3.基因组装分析软件1套。
4.分析软件1套（包含：原始电信号碱基读取分析模块1个；数据质量控制模块1个；barcode拆分模块1个；物种鉴定序列比对模块1个；宏基因组分析模块1个；扩增子分析模块1个；测序错误校正模块1个；癌症结构变异分析模块1个；脑肿瘤碱基修饰分析模块1个；CAS9靶向捕获序列分析模块1个；新冠全基因组分析模块1个；基因表达分析模块1个）。
5.分析服务器主机1台（内含：不低于128 GB DDR4内存、英特尔酷睿i9及以上CPU、不低于显存6 G的独立显卡、512 G及以上固态硬盘、8TB及以上SATA机械硬盘）。
6.≥34英寸高清电脑显示屏2台。
7.测序芯片1张。
8.连接测序试剂盒1个。
9.测序芯片引发试剂盒5个。
10.控制对照实验扩展试剂盒5个。
11.芯片清洗试剂盒5个。
12.连接法测序多样本DNA建库辅助试剂盒1个。
三、售后服务
★1.整机免费质保三年。
　 　 　 　
合同履行期限：合同签订后1个月内到货。
需落实的政府采购政策内容：中小微企业（含监狱企业）的规定；对于促进残疾人就业政府采购政策的规定、对于节能产品、环境标志产品的相关规定等。
本项目（是/否）接受联合体投标：否
二、供应商的资格要求
1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定。
2.落实政府采购政策需满足的资格要求：无。
3.本项目的特定资格要求：设备属于医疗器械的，需提供医疗器械生产许可证（国产产品制造厂家提供）、医疗器械经营许可证（或对应类别的备案凭证）、医疗器械注册证(有效期内)，否则提供设备不属于医疗器械的情况说明。
三、政府采购供应商入库须知
参加辽宁省政府采购活动的供应商未进入辽宁省政府采购供应商库的，请详阅辽宁政府采购网 “首页—政策法规”中公布的“政府采购供应商入库”的相关规定，及时办理入库登记手续。填写单位名称、统一社会信用代码和联系人等简要信息，由系统自动开通账号后，即可参与政府采购活动。具体规定详见《关于进一步优化辽宁省政府采购供应商入库程序的通知》（辽财采函〔2020〕198号）。
四、获取招标文件
时间：2022年11月29日 08时30分至2022年12月06日 17时30分（北京时间，法定节假日除外）
地点：线上获取
方式：线上
售价：免费
五、提交投标文件截止时间、开标时间和地点
2022年12月23日 15时00分（北京时间）
地点：辽宁承明招投标有限公司（沈阳市皇姑区黄河南大街106号丽阳商务大厦A座16层1602室）。
六、公告期限
自本公告发布之日起5个工作日。
七、质疑与投诉
供应商认为自己的权益受到损害的，可以在知道或者应知其权益受到损害之日起七个工作日内，向采购代理机构或采购人提出质疑。
1、接收质疑函方式：线上或书面纸质质疑函
2、质疑函内容、格式：应符合《政府采购质疑和投诉办法》相关规定和财政部制定的《政府采购质疑函范本》格式，详见辽宁政府采购网。
质疑供应商对采购人、采购代理机构的答复不满意，或者采购人、采购代理机构未在规定时间内作出答复的，可以在答复期满后15个工作日内向本级财政部门提起投诉。
八、其他补充事宜
1.本项目采用全流程电子招投标，参与本项目的供应商须自行办理好CA锁，供应商除在电子评审系统上传投标（响应）文件外，应在递交投标（响应）文件截止时间前提交按采购文件规定的介质形式（U盘）存储的可加密备份文件，并承诺备份文件与电子评审系统中上传的投标（响应）文件内容、格式一致，备系统突发故障使用。供应商仅提交备份文件或电子投标文件的，投标（响应）无效。详见辽宁政府采购网《关于完善政府采购电子评审业务流程等有关事项的通知》辽财采函{2021}363号。2.供应商自行准备电子设备确保能够自行报价及解密。3.电子投标文件在辽宁政府采购网线上提交，备份文件提交至辽宁承明招投标有限公司。
九、对本次招标提出询问，请按以下方式联系
1.采购人信息
名  称： 中国医科大学附属第一医院
地  址： 沈阳市和平区南京北街155号
联系方式： 张老师 024-83283232
2.采购代理机构信息：
名  称： 辽宁承明招投标有限公司
地  址： 沈阳市皇姑区黄河南大街106号丽阳商务大厦A座16层1602室
联系方式： 024-86803737
邮箱地址： liaoningshangyu@126.com
开户行： 光大银行沈阳皇姑支行
账户名称： 辽宁承明招投标有限公司
账号： 7581018800024251300007
3.项目联系方式
项目联系人： 孙少伟、郭晓川
电  话： 024-86803737

评分办法:最低评标价法;

关联计划

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