招标
玫瑰茄全基因组图谱开发（EJWJ2024157）采购公告
金额
4.95万元
项目地址
福建省
发布时间
2024/06/27
公告摘要
公告正文
| 项目名称 | 玫瑰茄全基因组图谱开发 | 项目编号 | EJWJ2024157 |
|---|---|---|---|
| 公告开始日期 | 2024-06-27 03:22:46 | 公告截止日期 | 2024-06-30 05:00:00 |
| 采购单位 | 福建农林大学 | 付款方式 | 待结题报告交付后，付全款。 |
| 联系人 | 登录后可见 | 联系电话 | 登录后可见 |
| 签约时间要求 | 成交后30日内 | 到货时间要求 | |
| 预算总价 | ￥ 49500.00 + NaN + NaN | ||
| 发票要求 | 增值税普通发票 增值税专用发票 | ||
| 含税要求 | |||
| 送货要求 | |||
| 安装要求 | |||
| 收货地址 | |||
| 供应商资质要求 | 符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件 | ||
| 公告说明 | |||
采购清单1
| 采购商品 | 采购数量 | 计量单位 | 所属分类 |
|---|---|---|---|
| 玫瑰茄全基因组图谱开发 | 1 | 项 | 农学研究服务 无 无 |
| 品牌 品牌1 | |
|---|---|
| 型号 | |
| 品牌2 | |
| 型号 | |
| 品牌3 | |
| 型号 | |
| 品牌4 | |
| 型号 | |
| 品牌5 | |
| 型号 | |
| 品牌6 | |
| 型号 | |
| 预算单价 | ￥ 49500.00 |
| 技术参数及配置要求 | 1、完成玫瑰茄样品的DNA提取，质检合格后构建三代测序基因组文库进行PacBio Revio测序技术平台HIFI测序模式测序并进行数据质控，测序数据量60Gb；构建二代测序基因组文库进行DNB-SEQ测序平台PE150测序策略测序并进行数据质控，测序数据量50G； 2、完成玫瑰茄样品的甲醛交联、细胞核提取，构建1个Hi-C文库，质检后基于illumina测序平台进行测序。测序数据量200Gb； 3、完成4个玫瑰茄不同组织样品的RNA提取，质检合格后进行基于DNB-SEQ平台进行常规转录组测序，测序数据量6G；取不同组织部位玫瑰茄样品进行RNA提取，质检合格后基于Nanopore平台进行转录组测序，测序数据量10G； 完成测序后进行HIFI单倍型基因组图谱分析，分析内容如下：(1)数据质控；(2)单倍型基因组组装（共组装2套）（组装、组装结果评估）；(3)HIC辅助基因组拼接，比对参考基因组，将组装得到的Contig挂载到染色体，挂载率>90%；(4)基因组注释基因组注释（重复序列注释、基因结构注释、基因功能注释、ncRNA注释）；(5)比较基因组学分析（基因家族分析、系统进化分析）；(6)单倍型基因组特有分析、亚基因组结构变异分析、亚基因组不对称进化分析（Ka/Ks差异分析）等位基因表达偏岐分析； 4、1）供应商样本提取合格率≥98%，对于DNA提取不合格样本，提取到合格为止。 2）供应商针对检测合格后的样品(样本总量≥ 100ng)，搭配自动化建库仪器，通量做到1人/4H/96个样本。 3）供应商拥有自主nanopore测序仪并服务过使用Nanopore平台测序的用户，并发表过文章。 |
| 参考链接 | |
| 售后服务 | 7×24小时技术支持，服务响应时限:反馈问题后2小时内; |
2024-06-27 03:22:46
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