招标
衢州市人民医院单细胞测序及数据分析服务2024年3月政府采购意向
金额
200万元
项目地址
浙江省
发布时间
2024/03/27
公告摘要
公告正文
衢州市人民医院单细胞测序及数据分析服务2024年3月政府采购意向
为便于供应商及时了解政府采购信息,根据《财政部关于开展政府采购意向公开工作的通知》(财库〔2020〕10号)等有关规定,现将衢州市人民医院单细胞测序及数据分析服务2024年3月采购意向公开如下:
采购单位 | 衢州市人民医院 |
采购项目名称 | 衢州市人民医院单细胞测序及数据分析服务 |
采购品目 | C04010100综合医院服务 |
采购需求概况 | 一)技术参数 1. 10X Genomics人外周血单细胞mRNA测序 2. 具有全面的单细胞活性检测指标,保证单细胞的质量 3. 构建单细胞mRNA测序文库时,细胞活性≥80%,细胞数量≥5x105个,细胞浓度在700-1200个cell/ml 4. 采用10X Genomics的单细胞建库仪器及原装配套试剂进行单细胞文库的构建 5. 细胞数量≥5000个/sample,数据量≥150G clean data/sample 6. 二代高通量测序Illumina NovaSeq 6000平台,测序读长 PE150。 7. 测序质量:clean data Q20≥90%,Q30≥85% 8. 供应商提供以下标准信息分析内容,包括: 1)有效Barcode统计,测序饱和度统计; 2)基本数据分析,细胞数目统计,单个细胞reads数目统计等; 3)基因表达定量,获得表达基因及其表达量数据; 4)聚类分析,提供tSNE聚类分析结果; 5)差异基因分析,针对不同cluster 中的基因进行差异分析。 6)差异基因功能富集,包括GO和KEGG; 9. 供应商应具备但不限于以下个性化分析能力: 1)细胞分群注释,对不同细胞亚群进行辅助定义; 2)拟时分析,预测细胞演化/分化过程; 3)受配体分析,分析细胞之间的相互作用; 4)目标亚群进一步分析,针对关注细胞亚群进一步分析; 5)差异基因 TF 注释 10. 供应商需具有充足的项目经验和专业技术人员,有能力保证本项目的顺利开展;具备客服部,且一周七天均可对甲方相关人员的问题进行实时响应; (二)质量要求 1. 构建单细胞mRNA测序文库时,细胞活性≥80%,细胞数量≥5x105个,细胞浓度在700-1200个cell/ml 2. 细胞数量≥5000个/sample,数据量≥150G clean data/sample 3. 测序质量:clean data Q20≥90%,Q30≥85% (三)功能目标 通过每个细胞的转录本 3’端的转录组信息,在转录组的层面展开细胞类型分群、信号通路差异响应、分子调控网络、细胞异质性等方面的研究。 (四)服务周期 1. 项目完成期限:自样本检测全部合格,项目启动之日起30个自然日之内必须完成全部检测项目。 |
预算金额(元) | 2000000 |
预计采购时间 | 2024年05月 |
中小企业预留情况 | 中小企业预留 |
落实政府采购政策功能情况 | |
联系人 | 超级机构管理员 |
联系电话 | 0570-3122918 |
备注 |
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衢州市人民医院
2024年03月27日
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