公告摘要
项目编号wll-fw-ks-nm-2023-0197
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公告正文





项目名称1 全外显子捕获测序分析 项目编号 WLL-FW-KS-NM-2023-0197
公示开始日期 2023-10-09 13:36:24 公示截止日期 2023-10-12 14:00:00
采购单位 西湖实验室(生命科学和生物医学浙江省实验室) 付款方式 合同签订后支付合同经费30%,测试服务验收后支付70%
联系人 中标后在我参与的项目中查看 联系电话 中标后在我参与的项目中查看
到货时间要求 预算总价 ¥ 497,250
收货地址
供应商资质要求
符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件

; 被授权人社保缴纳证明 (近3个月) (必选) ; 法定代表人资格证明书 (联系人须与法定代表人一致)/投标授权委托书(联系人须与被授权人一致) (必选)



采购清单1
采购物品 采购数量 计量单位 所属分类
全外显子捕获测序分析 765
品牌
规格型号
预算 ¥ 650
技术参数 1. 测序平台: 华大T7,或 Illumina novaseq 6000 。
2. 测序深度:100x,数据量12Gb。
3. 捕获探针:MGN-ExomeV6 DNA双链探针;
4. 每个上机测序的样本测序数据的单碱基质量评估指数Q20≥94%,Q30>85%,去除接头污染和低质量数据过滤后Q30 >90%;碱基类型分布均匀,无GC分离;去除数据冗余后比对率达到91%以上;参考基因组比对效率达到98%以上;错误率<0.1%。
5. 平均覆盖率(1X)>99%;每个样本捕获区域的精准覆盖率(>20X)应≥96%;样本捕获区间均一性超过98%。
6. 使用的分析数据库是权威开源的数据库,数据库超过50个,包块人群数据库1000genomes、ESP6500、ExAC、gnomAD、检验所自己的健康人群数据库;疾病数据库:OMIM、Clinvar、HGMD、Berry(40K)等;错义突变危害预测软件:SIFT、Polyphen、dann、gerp++gt2、LRT、MutationTaster、FATHMN、PROVEAN、VEST3、MetaSVM、MetalLR、M-CAP、REVEL、CADD等;
7. 分析内容:
1)外显子SNV 、indel
2)大片段CNV
3)线粒体基因变异
4)UPD/LOH
5)深度覆盖内含子区已知致病位点
6)SMN1/DMD/地中海贫血外显子缺失
7)提供个性化分析或帮助
售后服务



西湖实验室(生命科学和生物医学浙江省实验室)

2023-10-09 13:36:24

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