招标
16例小鼠消化道肿瘤单细胞3'转录组建库测序
金额
17.59万元
项目地址
广东省
发布时间
2023/09/28
公告摘要
项目编号-
预算金额17.59万元
招标公司-
招标联系人-
标书截止时间-
投标截止时间-
公告正文
基本信息:
采购明细:
采购明细:
序号 | 采购内容 | 数量/单位 | 预算单价 | 品牌 | 型号 | 规格参数 | 质保及售后服务 | 附件 |
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1 | 16例小鼠消化道肿瘤单细胞3'转录组建库测序 | 1.0/项 | 175984.0 | None | None | 一、服务清单: 完成16例消化道肿瘤的单细胞转录组建库及测序;每个样本交付原始数据量不低于100G,且目标捕获细胞数≥6000个。 1. 合同签订后1天内,可提供保存效果长达72h的组织保存液; 2. 样本接收后2天内,可完成样本质检; 3. 样本接收后14个工作日内,完成单细胞捕获、文库构建测序等实验。 4. 服务范围:样本质检、单细胞转录组建库和测序、实验经过汇报、项目结题报告。 二、服务要求: 1、样本处理要求:响应供应商应提供组织样本的保存试剂,保证样本离体72h后的稳定性,并能够用于后续单细胞悬液的制备。可提供组织解离试剂,独立完成对采购人寄送的样本进行单细胞悬液的制备。响应供应商具备成功解离消化道肿瘤等难解离样本的能力,可完成单细胞悬液的质检,解离后的单细胞悬液QC:① 细胞活率>90%;② 细胞结团率<10%;③ 活细胞浓度范围:700 ~ 1200cells/μl,悬液体积>100ul;④ 有核率>70%;⑤ 细胞直径范围:5~70μm,可包含多种细胞类型;⑥ 不存在逆转录抑制剂和非细胞的核酸分子。制备的单细胞悬液满足后续的单细胞捕获和建库需求。 2、单细胞分离标记:供应商基于微液滴法可完成单细胞悬液的分离标记,满足后续构建测序文库。 3、测序文库构建:响应供应商提供单细胞建库试剂盒,可用单细胞悬液构建带标签的转录组测序文库,可以满足不同样本的建库需求。构建好的文库进行文库质量检测,测序文库QC:cDNA浓度≥0.5ng/μl,文库浓度≥3ng/μl,cDNA主峰长度不低于750bp,文库长度分布350bp-700bp。对符合标准的文库进行后续的上机。 4、测序平台:用高通量测序兼容Illunima和MGI双测序平台,测序策略PE150。 测序质量要求: Q20>85%, Q30>80%, 碱基类型分布均匀。 5、 测序数据量:单细胞转录组文库提供≥100 Gb raw data,目标捕获细胞数不低于6000个细胞/样本,测序质量要求:Q20>85%,Q30>80%,碱基类型分布均匀,采用严格的数据质控标准,保证数据质量。 | 详见附件-竞价采购文件 | 竞价采购需求-16例小鼠消化道肿瘤单细胞3'转录组建库测序 发布版.xlsx |
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