广州市轨道交通三号线北延段已于2010年开通运营，京溪南方医院站位于广州大道北与京溪路交叉路口以北，南方医院西南侧，沿广州大道呈西南-东北走向，站位所处的广州大道北现状为路宽40米的8车道的城市主干道。京溪南方医院站是三号线北延段的第三个车站，位于广州大道北春兰花园西北侧，总共设有4个出入口，其中III、IV号出入口已经建成，本次建设内容为II号出入口。II号出入口位于车站主体东侧，广州大道北道路东侧、云景花园与春兰花园之间的南溪商业街上，本出入口地下部分建筑面积882.5㎡，地面部分138.6㎡，通道总长约110.4m（其中顶管段通道长约35.7m）。