招标
广西药用植物园关于“辅助决策知识库”开发服务项目采购的公告
金额
38万元
项目地址
广西壮族自治区
发布时间
2024/08/13
公告摘要
项目编号-
预算金额38万元
招标联系人马工0771-5603824
标书截止时间-
投标截止时间-
公告正文
广西药用植物园关于“辅助决策知识库”开发服务项目采购的公告
 
广西药用植物园因科研工作需要,拟对“辅助决策知识库”开发服务项目进行采购。有关事项公告如下:
一、采购项目名称
“辅助决策知识库”开发服务项目
二、预算金额
38万元(含税)
三、采购需求主要内容
在指定的30个权威公开生物医学数据库获取所有数据信息,再将获取到的数据进行清理,整合,转换,最终通过数据库设计、存储与部署,创建形成新的辅助决策知识库,并且基于辅助决策知识库做生物信息学分析。项目在质保期内,若源数据库信息产生更新,则需同步更新至该辅助决策知识库。
四、具体需求参数
(一)数据库类型:结构化数据库MySQL
(二)数据格式:包括以下两类:
1.结构化数据表,存储到MySQL数据库,格式为.sql文件;
2.非结构化数据,以文本形式存储,格式为文本.txt等;
(三)数据量:
各个源数据库包含的实体类型,关系类型以及数据量都有所差别,因此实际数据量无法确定,暂按每个数据库中能找到的数据及数量进行参考。
一级类别
二级类别
数据库
数据量(参考值)
基因/蛋白
基因信息
基因数据库NCBI Gene
60000个基因
分子通路/
分子功能
分子通路数据库KEGG
305个通路
分子功能标注数据库COG
4600个COGs
分子功能标注数据库GO
47000个GO条目
蛋白相互作用关系数据
蛋白互作数据库STRING11
839000 PPIs(Score>700)
蛋白互作数据库BioGRID
860000 PPIs
蛋白互作数据库HI_union
62000 PPIs
蛋白互作数据库IntAct
7600 PPIs
中药
中药、成分、靶点、疾病及其关系
中药分子信息数据库SymMap
658个中药、24000个成分、19000个靶点、13000个疾病以及它们之间的关系
中医药百科全书数据库ETCM
1800个草药,37000个成分,1040个靶点以及它们之间的关系
本草组鉴数据库HERB
6900个中药,47000个成分,12800个靶点以及它们之间的关系
中药系统药理学数据库和分析平台TCMSP
449个中药,11000个成分,以及它们之间的关系
中药分子信息数据库TCMBank
8900个中药,59000个成分,13500个靶点以及它们之间的关系
中药分子靶点数据库HIT2.0
1100个中药,1100个成分,2000个靶点以及它们之间的关系
中药分子靶点数据库BATMAN
8300个中药,38000个成分,9500个蛋白以及它们之间的关系
中药毒理
中药系统毒理学数据库TCMSTD
242个中药,4100个成分,210个有毒成分,2300个靶点,以及它们之间的关系
中药肝损伤
药物性肝损伤专业数据库Hepatox
西药,中药和中成药共600余个
中药代谢
中药血液吸收成分及代谢物数据库DCABM-TCM
184个中药,1640个化合物以及它们之间的关系
西药/化合物
药物及靶点
药物靶点数据库DrugBank
5200个药物,2100个靶点以及它们之间的关系
药物靶标数据库TTD
38000个药物,3600个靶点以及它们之间的关系
配体受体数据库GLASS
51余万化合物靶点关系
药物分子靶标数据库BindingDB
538000余化合物,2600余靶点以及它们之间的关系
化合物及靶点机制
化合物数据库ChEMBL
230余万化合物,14000余靶点以及它们之间的关系
比较毒物基因组库CTD
13000余化合物,51000余基因以及它们之间的关系
药物肝损伤
药物肝损伤数据库LiverTox
560个药物
药物副作用
药物副作用资源数据库SIDER
1000药物和920个疾病表型以及它们之间的关系
疾病/表型
疾病信息及分子机制
疾病分子信息数据库SympGAN
17000余疾病表型和18000余基因以及它们之间的40余万关系
疾病基因关系数据库DisGeNet
12000个疾病和8500个基因以及它们之间的13余万关系
疾病分子信息数据库OMIM
6200个疾病表型和15000个基因信息
疾病分子信息数据库MalaCards
18000个疾病及其基因信息

 
 五、报价资料(文件名称格式请命名“辅助决策知识库”开发服务项目报价—xxx公司(xx万元),按顺序排版PDF,每页加盖公章)。
(一)封面:报价项目名称、报价公司、联系人及电话;
(二)营业执照副本扫描件(原件备查);
(三)公司法定代表人身份证明,授权委托人的授权委托书及身份证扫描件(原件备查)。企业信誉状况良好,自成立以来三年内无违法记录。
(四)开发服务内容及报价(含税)。
六、报价方式及要求
报价时间:2024年8月13日起至8月16日18:00截止。
报价方式:网络邮箱报价。
邮箱:gxyyzwykybcg@163.com
联系人:0771-5603824  马工
纪检监督电话:0771-5614795 朱老师
     
  
广西壮族自治区药用植物园
2024年8月13日
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